RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000255641.12

CSNK1G2-201, Transcript of casein kinase 1 gamma 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CSNK1G2, Length 2,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1G2-201ENST00000255641 DSC1Q08554 894 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 OTOP2Q7RTS6 562 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HMGN2P46Q86SG4 172 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MMP21Q8N119 569 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAD9AQ99638 391 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CHST8Q9H2A9 424 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLEC4EQ9ULY5 219 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLXNA3P51805 1871 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR6C70A6NIJ9 312 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CDRT1O95170 752 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MAPK1P28482 360 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ARPC4P59998 168 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPS26P62854 115 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HBA1P69905 142 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HYAL2Q12891 473 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MPPE1Q53F39 396 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HHIPQ96QV1 700 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC22A12Q96S37 553 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DYRK4Q9NR20 520 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 VPS29Q9UBQ0 182 aa20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1SP09871 688 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HIST1H2ADP20671 130 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAB25P57735 213 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ABRQ12979 859 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 VEPH1Q14D04 833 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 FBXO43Q4G163 708 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CEP78Q5JTW2 689 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 IQCF1Q8N6M8 205 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HIST1H2AJQ99878 128 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 H2AFJQ9BTM1 129 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF556Q9HAH1 456 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRRDQ9UH36 339 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C1orf226A1L170 272 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMEM202A6NGA9 273 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C6orf47O95873 294 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSNK2BP67870 215 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 NFE2L1Q14494 772 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HS6ST3Q8IZP7 471 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C11orf65Q8NCR3 313 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SLC7A6Q92536 515 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRRQ9GZT4 340 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 POFUT2Q9Y2G5 429 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PADI2Q9Y2J8 665 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 KLK4Q9Y5K2 254 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C5orf42Q9H799 3197 aa20.34■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 AP2A2O94973 939 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CBLP22681 906 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DDOSTP39656 456 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 RAE1P78406 368 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 KRR1Q13601 381 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DOC2AQ14183 400 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MACC1Q6ZN28 852 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZNF367Q7RTV3 350 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 NOXA1Q86UR1 476 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 TMCO6Q96DC7 493 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 STARD7Q9NQZ5 370 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ACER3Q9NUN7 267 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 DNAJC11Q9NVH1 559 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 ADAMDEC1O15204 470 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSO75390 466 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HBQ1P09105 142 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 PFN3P60673 137 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CYP4F8P98187 520 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 C5orf22Q49AR2 442 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 NPAS3Q8IXF0 933 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 MYLIPQ8WY64 445 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 KCTD5Q9NXV2 234 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 CLCA3PQ9Y6N3 262 aa20.33■□□□□ 0.85
CSNK1G2-201ENST00000255641 OR2AG2A6NM03 316 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 SDHBP21912 280 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 UBE3AQ05086 875 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 BCL2L1Q07817 233 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 DEFB115Q30KQ5 88 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 IFI44LQ53G44 452 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 PLAG1Q6DJT9 500 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 C22orf42Q6IC83 251 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 RNF130Q86XS8 419 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 CARD8Q9Y2G2 431 aa20.33■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.32■□□□□ 0.84
CSNK1G2-201ENST00000255641 TPST2O60704 377 aa20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.4 ms