RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 DNAJC13O75165 2243 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 HCFC1P51610 2035 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 NF1P21359 2839 aa14.7□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 URADA6NGE7 173 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TOXO94900 526 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 GUCA1CO95843 209 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 SERPINA6P08185 405 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 CLCN2P51788 898 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 EMC4Q5J8M3 183 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TMEM211Q6ICI0 200 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 NXPE4Q6UWF7 544 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 SBSNQ6UWP8 590 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PDLIM5Q96HC4 596 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TSNARE1Q96NA8 513 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 RHBGQ9H310 441 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PELI2Q9HAT8 420 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 SLC17A6Q9P2U8 582 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 RNF6Q9Y252 685 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 VWA7Q9Y334 891 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 MMACHCQ9Y4U1 282 aa14.69□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TMEM200CA6NKL6 621 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 FANCGO15287 622 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 BANF1O75531 89 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 ITGA10O75578 1167 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TTC4O95801 387 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 RUNX2Q13950 521 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TERF2Q15554 542 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 MSS51Q4VC12 460 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 IGDCC3Q8IVU1 814 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 SCUBE1Q8IWY4 988 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 RPRMLQ8N4K4 120 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TMEM156Q8N614 296 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 ARMC2Q8NEN0 867 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 ASB5Q8WWX0 329 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PBKQ96KB5 322 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 UCK2Q9BZX2 261 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 DEPPQ9NTK1 212 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 SLC22A14Q9Y267 594 aa14.68□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PINLYPA6NC86 204 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TGFBR3LH3BV60 316 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 NRDCO43847 1150 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PRKNO60260 465 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PDE9AO76083 593 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 MYO1DO94832 1006 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PPP2R1BP30154 601 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 CHRNB4P30926 498 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 GPR85P60893 370 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 BTN3A2P78410 334 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 SPANXN3Q5MJ09 141 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 ARHGAP11AQ6P4F7 1023 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 RND1Q92730 232 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 CERS2Q96G23 380 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TP63Q9H3D4 680 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 FBXW2Q9UKT8 454 aa14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 MSX1P28360 303 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 XKR6Q5GH73 641 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 GPATCH11Q8N954 259 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TMEM52Q8NDY8 209 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 NCLNQ969V3 563 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 VMP1Q96GC9 406 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 NAT9Q9BTE0 207 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 DEFB127Q9H1M4 99 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PNO1Q9NRX1 252 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 KCMF1Q9P0J7 381 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 DYRK1BQ9Y463 629 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 KCNE2Q9Y6J6 123 aa14.66□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 ITPR3Q14573 2671 aa14.65□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PHF3Q92576 2039 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 USP27XA6NNY8 438 aa14.65□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 FOXO6A8MYZ6 492 aa14.65□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 ZFAND5O76080 213 aa14.65□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 TUBB4AP04350 444 aa14.65□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
NME3-201ENST00000219302 FNTAP49354 379 aa14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms