RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000076372.4

Sf3b4-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b4, Length 1,915 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 SnrpnP63163 240 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kpnb1P70168 876 aaKnown RBP14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tbx6P70327 436 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Serpina3mQ03734 418 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 SctQ08535 133 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Inf2Q0GNC1 1273 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Kcna7Q17ST2 489 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dusp5Q1HL35 384 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 HexdcQ3U4H6 486 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lrrc58Q3UGP9 366 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Timm8a2Q4FZG7 97 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 DgkbQ6NS52 802 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tvp23aQ6NVH0 222 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ubxn7Q6P5G6 467 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Klhdc10Q6PAR0 439 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1134Q7TR43 312 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hs3st3a1Q8BKN6 393 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pithd1Q8BWR2 211 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Mrgprb5Q91ZB9 322 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Prl7c1Q9CRB5 251 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Upk1aQ9D132 257 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rcan2Q9JHG2 197 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Lhx9Q9WUH2 397 aa14.75□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tox2A2A472 547 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ttc39aA2ACP1 578 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Susd5G3UW60 619 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm11168J3QN50 228 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Hk2O08528 917 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rem1O35929 297 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 GcatO88986 416 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 AladP10518 330 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 GsnP13020 780 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 PdxpP60487 292 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Serpina7P61939 418 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zfp935Q14DI0 353 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tex10Q3URQ0 928 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cr1lQ64735 483 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Oscp1Q8BHW2 379 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ahi1Q8K3E5 1047 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr693Q8VF89 316 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Dhx36Q8VHK9 1001 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Fam118aQ91YN1 357 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gemin6Q9CX53 166 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Wars2Q9CYK1 360 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 MecrQ9DCS3 373 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Enpp2Q9R1E6 862 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Snrnp200Q6P4T2 2136 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gtf3c1Q8K284 2101 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Wfdc11A2A5H7 82 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 6330409D20RikA2AK85 162 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 5430403G16RikD3Z5L4 667 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn2r61L7N2B8 865 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ift81O35594 676 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gtf2h4O70422 463 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 DdcO88533 480 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 InvsO89019 1062 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vwa5b2Q3UR50 1248 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tubal3Q3UX10 446 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm5431Q5NCB3 844 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rnf145Q5SWK7 663 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 WlsQ6DID7 541 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 DcstampQ7TNJ0 470 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1085Q7TR64 313 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Carnmt1Q80UY1 400 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 C2cd4bQ80XU5 340 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Arrb1Q8BWG8 418 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Pcdhb3Q91XZ7 784 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Cyb5r1Q9DB73 305 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Emc7Q9EP72 241 aa14.74□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Igkv4-86A0A0G2JGE7 114 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gm13040A2A8C4 496 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr1153A2AVC0 318 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Otud3B1AZ99 396 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Ifi213D3Z5G0 586 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olfr564E9PWA8 316 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Spaca6E9Q8Q8 339 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r31L7N2F1 303 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Chil3O35744 398 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 FhitO89106 150 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 BdnfP21237 249 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gli1P47806 1111 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 EvlP70429 414 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Bop1P97452 732 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Eif1adQ3THJ3 170 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sel1l2Q3V172 688 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sim2Q61079 657 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Sp9Q64HY3 484 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gpalpp1Q69ZC8 346 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Olig3Q6PFG8 273 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gpr141Q7TQP0 305 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Tprg1Q8CB49 279 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Vmn1r219Q8R271 312 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Rnf138Q9CQE0 245 aaKnown RBP14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Atp13a2Q9CTG6 1169 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Glipr1Q9CWG1 255 aa14.73□□□□□ -0.05
Sf3b4-201ENSMUST00000076372 Gid8Q9D7M1 228 aa14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 26.1 ms