RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000044277.9

Chmp4b-201, Transcript of Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Chmp4b, Length 1,616 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Hnrnph1O35737 449 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Foxq1O70220 400 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Myf5P24699 255 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tbx6P70327 436 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Lrrc74bQ14BP6 391 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Bnc2Q8BMQ3 1127 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Ints14Q8R3P6 515 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Pcdhga11Q91XY8 933 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Ndufs4Q9CXZ1 175 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Stard5Q9EPQ7 213 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 AgtrapQ9WVK0 161 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Il18bpQ9Z0M9 193 aa26.52■■□□□ 1.84
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Igkv4-86A0A0G2JGE7 114 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 9630041A04RikD3Z3U4 205 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tssk2O54863 358 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tnfsf9P41274 309 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 PdxpP60487 292 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Msx2Q03358 267 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tie1Q06806 1134 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Krtcap2Q5RL79 136 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Gpr39Q5U431 456 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tvp23aQ6NVH0 222 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 GnptgQ6S5C2 307 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Slco4c1Q8BGD4 722 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Znf451Q8C0P7 1056 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Lgi4Q8K1S1 537 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Rnh1Q91VI7 456 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Pcdhga4Q91XY4 930 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Zswim1Q9CWV7 455 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Lypd2Q9DD23 127 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Rcan2Q9JHG2 197 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Cts8Q9JI81 333 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Mrpl40Q9Z2Q5 206 aa26.51■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Gm5141A0A0J9YUW3 581 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Zfp300A2AE21 645 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Slc43a3A2AVZ9 502 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 DctP29812 517 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Csrp2P97314 193 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Pros1Q08761 675 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Wnk2Q3UH66 2149 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Mapkapk3Q3UMW7 384 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Usp7Q6A4J8 1103 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Rbbp8Q80YR6 893 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Sept11Q8C1B7 431 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Sidt2Q8CIF6 832 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Slf1Q8R3P9 1054 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Usp18Q9WTV6 368 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Ptpn4Q9WU22 926 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Ybx2Q9Z2C8 360 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Itga8A2ARA8 1062 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 HgdO09173 445 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Rem1O35929 297 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tbc1d10aP58802 500 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Epha4Q03137 986 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Ap5b1Q3TAP4 876 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 HexdcQ3U4H6 486 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Fam83eQ80XS7 481 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Fbxo30Q8BJL1 746 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Nt5dc1Q8C5P5 467 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Olfr570Q8VH12 312 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Myo1cQ9WTI7 1063 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Zbtb18Q9WUK6 522 aa26.5■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Gm5938A2AEN9 163 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tmem74bA2AU34 232 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Prrt4B2RU40 902 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Cdr1E9Q0B4 517 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 FshrP35378 692 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Entpd1P55772 510 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Zfp935Q14DI0 353 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tmem173Q3TBT3 378 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Gpsm3Q3U1Z5 159 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 UnklQ5FWH2 727 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Trpc1Q61056 793 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Csnk1g2Q8BVP5 415 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Pramef8Q8CE24 480 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Def8Q99J78 448 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Coro7Q9D2V7 922 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tmem35aQ9D328 167 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 PaplnQ9EPX2 1280 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Lhx9Q9WUH2 397 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Gdf2Q9WV56 428 aa26.49■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Krt90E9Q1Z0 538 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Zfp934K7N6H3 473 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 IkbkgO88522 412 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Tmco2P0C1V4 183 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Sat1P48026 171 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 CcnfP51944 777 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 KizQ3UXL4 695 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Fam71bQ5STT6 665 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Mfn1Q811U4 741 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Q8CIL4 281 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Olfr183Q8VFB9 309 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Ucn3Q924A4 164 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Ankrd61Q9CQM6 421 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Stpg4Q9DAG5 247 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Rad1Q9QWZ1 280 aa26.48■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Proca1B0QZF7 307 aa26.47■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Cldn24D3YXJ9 220 aa26.47■■□□□ 1.83
Chmp4b-201ENSMUST00000044277 Znf296E9Q6W4 445 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 56.5 ms