RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039061.14

Trappc11-201, Transcript of Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Trappc11, Length 4,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trappc11-201ENSMUST00000039061 LaynQ8C351 381 aa11.13□□□□□ -0.63
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Trappc11-201ENSMUST00000039061 Ech1O35459 327 aa11.12□□□□□ -0.63
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