RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	SEMA5A	Q13591	1074 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF460	Q14592	562 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SYTL3	Q4VX76	610 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LDLRAP1	Q5SW96	308 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GRTP1	Q5TC63	336 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PLEKHM3	Q6ZWE6	761 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SPATC1	Q76KD6	591 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZBTB46	Q86UZ6	589 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NUDCD3	Q8IVD9	361 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CCDC103	Q8IW40	242 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FNDC5	Q8NAU1	212 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KCT2	Q8NC54	265 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ELMO1	Q92556	727 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HTRA1	Q92743	480 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HDAC2	Q92769	488 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FCRL3	Q96P31	734 aa	Predicted RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC61	Q9BV99	259 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	INTS7	Q9NVH2	962 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ENOPH1	Q9UHY7	261 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZMIZ1	Q9ULJ6	1067 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PLAGL1	Q9UM63	463 aa		6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	6.97	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	AKAP13	Q12802	2813 aa		6.96	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ANKRD11	Q6UB99	2663 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BTN3A1	O00481	513 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ST8SIA5	O15466	376 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC7A4	O43246	635 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LILRB5	O75023	590 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM155B	O75949	473 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MT-ND3	P03897	115 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF806	P0C7X5	589 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TYK2	P29597	1187 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GRK3	P35626	688 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CSNK1D	P48730	415 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NXPH1	P58417	271 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TUBB3	Q13509	450 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MFSD13A	Q14CX5	517 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TSC22D1	Q15714	1073 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CARTPT	Q16568	116 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TEDDM1	Q5T9Z0	273 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM69	Q86WT6	500 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC25A45	Q8N413	288 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RCBTB1	Q8NDN9	531 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	OR4L1	Q8NH43	312 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFP90	Q8TF47	636 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DNASE2B	Q8WZ79	361 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	LPGAT1	Q92604	370 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GTF2H4	Q92759	462 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM111A	Q96PZ2	611 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MCCC1	Q96RQ3	725 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ORAI3	Q9BRQ5	295 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	XKR8	Q9H6D3	395 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	EFCAB1	Q9HAE3	211 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	METRN	Q9UJH8	293 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	GPR34	Q9UPC5	381 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MEN1	O00255	615 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ARHGEF9	O43307	516 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NIPSNAP2	O75323	286 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SNN	O75324	88 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CER1	O95813	267 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TNF	P01375	233 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	BMP4	P12644	408 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF30	P17039	623 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	F8A1	P23610	371 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMA3	P25788	255 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ADRA1A	P35348	466 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	BST1	Q10588	318 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	BMPR2	Q13873	1038 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	SEMA3A	Q14563	771 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	NFATC4	Q14934	902 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	CSRP2	Q16527	193 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	DGUOK	Q16854	277 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF773	Q6PK81	442 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	MICU2	Q8IYU8	434 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	RASGEF1A	Q8N9B8	481 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	BHLHE22	Q8NFJ8	381 aa	Predicted RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	OR13J1	Q8NGT2	312 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX47	Q8TBZ9	253 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PHF10	Q8WUB8	498 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	KLHL6	Q8WZ60	621 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	TBRG4	Q969Z0	631 aa	Known RBP eCLIP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	COQ10A	Q96MF6	247 aa		6.96	□□□□□ -1.3
LETMD1-238	ENST00000623495	PPA2	Q9H2U2	334 aa		6.96	□□□□□ -1.3

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