RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SGMS1-210ENST00000619438 NR1D2Q14995 579 aa20.64■□□□□ 0.89
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SGMS1-210ENST00000619438 ABRAXAS1Q6UWZ7 409 aa20.64■□□□□ 0.89
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SGMS1-210ENST00000619438 CLCA4Q14CN2 919 aa20.61■□□□□ 0.89
SGMS1-210ENST00000619438 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP20.61■□□□□ 0.89
SGMS1-210ENST00000619438 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
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SGMS1-210ENST00000619438 METRNLQ641Q3 311 aa20.61■□□□□ 0.89
SGMS1-210ENST00000619438 RAB11FIP2Q7L804 512 aa20.61■□□□□ 0.89
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