RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	CAPRIN1	Q14444	709 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	MLC1	Q15049	377 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	C6orf52	Q5T4I8	152 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	RNF220	Q5VTB9	566 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM211	Q6ICI0	200 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	KLHL10	Q6JEL2	608 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	MZT2A	Q6P582	158 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	GDPD4	Q6W3E5	623 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	B4GALNT4	Q76KP1	1039 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SLC9B2	Q86UD5	537 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TAC4	Q86UU9	113 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PAQR7	Q86WK9	346 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SIX6OS1	Q8N1H7	587 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC17	Q8N6Y2	441 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ARIH2OS	Q8N7S6	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	DCAF4L2	Q8NA75	395 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LMO3	Q8TAP4	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	FAM222B	Q8WU58	562 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	NELFB	Q8WX92	580 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PHF3	Q92576	2039 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF501	Q96CX3	271 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	COQ8B	Q96D53	544 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	HMCES	Q96FZ2	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LRFN5	Q96NI6	719 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	SERPINB11	Q96P15	392 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CCL19	Q99731	98 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	FRMD8	Q9BZ67	464 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM7	Q9C029	511 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ACTR5	Q9H9F9	607 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM8A	Q9HCN3	771 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D29	Q9UFV1	150 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D30	Q9Y2I9	924 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	COQ4	Q9Y3A0	265 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MLH1-223	ENST00000616768	ANKRD12	Q6UB98	2062 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SCN2A	Q99250	2005 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA6B	A6NDN3	693 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SPRY2	O43597	315 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ASNA1	O43681	348 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SMC2	O95347	1197 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PIGN	O95427	931 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	WDPCP	O95876	746 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	JCHAIN	P01591	159 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	HOXC4	P09017	264 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ITGA2	P17301	1181 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SRD5A1	P18405	259 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM23	P36406	574 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	CAPZB	P47756	277 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	FMO5	P49326	533 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	RGS7	P49802	495 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	MXI1	P50539	228 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TUBB4B	P68371	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ARF5	P84085	180 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	FKBP3	Q00688	224 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC63	Q05C16	580 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ENPEP	Q07075	957 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ELP6	Q0PNE2	266 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TUBB2A	Q13885	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	VEZF1	Q14119	521 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SLC29A2	Q14542	456 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	LARS2	Q15031	903 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ETFDH	Q16134	617 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ALF	Q53S48	1182 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	C1orf189	Q5VU69	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PNCK	Q6P2M8	343 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	IYD	Q6PHW0	289 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	LEKR1	Q6ZMV7	388 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	DEF8	Q6ZN54	512 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	RBM43	Q6ZSC3	357 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM74	Q86UV6	250 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	GHDC	Q8N2G8	530 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	OR10Q1	Q8NGQ4	319 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	IPCEF1	Q8WWN9	437 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PIGT	Q969N2	578 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	ZBED6CL	Q96FA7	236 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	DHTKD1	Q96HY7	919 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	SLC41A2	Q96JW4	573 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	BTN2A3P	Q96KV6	586 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PIP5K1A	Q99755	562 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	PKP2	Q99959	881 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TRIM51	Q9BSJ1	452 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		4.58	□□□□□ -1.68
MLH1-223	ENST00000616768	HES7	Q9BYE0	225 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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