RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602338.1

TTLL3-233, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

Gene TTLL3, Length 693 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-233	ENST00000602338	LRRC8E	Q6NSJ5	796 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	LMNTD2	Q8IXW0	634 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	APCDD1L	Q8NCL9	501 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM57A	Q8TBR7	257 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NT5C	Q8TCD5	201 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NEIL2	Q969S2	332 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SNF8	Q96H20	258 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM167B	Q9BTA0	163 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NECTIN3	Q9NQS3	549 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	ZNF223	Q9UK11	482 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MAGEB16	A2A368	324 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338		A8MUA0	341 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC16A5	O15375	505 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CDC40	O60508	579 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PRMT3	O60678	531 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	BANF1	O75531	89 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TPO	P07202	933 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	PTGS2	P35354	604 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HNF4A	P41235	474 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SCTR	P47872	440 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS4	P49798	205 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	GPR85	P60893	370 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	RAB8A	P61006	207 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CRYM	Q14894	314 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	EMC4	Q5J8M3	183 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MDGA2	Q7Z553	956 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SULF2	Q8IWU5	870 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO1H	Q8N1T3	1032 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	NAT8L	Q8N9F0	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SERBP1	Q8NC51	408 aa	Known RBP eCLIP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	CALML6	Q8TD86	181 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HAUS8	Q9BT25	410 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	KLHL31	Q9H511	634 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	HOMER3	Q9NSC5	361 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	KLF13	Q9Y2Y9	288 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	AKAP6	Q13023	2319 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TTLL3-233	ENST00000602338	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CDK2AP1	O14519	115 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PEX1	O43933	1283 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TFEB	P19484	476 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PPP2R1B	P30154	601 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	REEP5	Q00765	189 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	RGS1	Q08116	209 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	C16orf47	Q6ZP98	133 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CYP4Z2P	Q8N1L4	340 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP62	Q8NB50	900 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	POGLUT1	Q8NBL1	392 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	C16orf52	Q8NHV5	167 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MS4A14	Q96JA4	679 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	DEFB126	Q9BYW3	111 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	UCK2	Q9BZX2	261 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	RHBG	Q9H310	441 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	DEPP	Q9NTK1	212 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	RNF6	Q9Y252	685 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	CLDN16	Q9Y5I7	305 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ACAN	P16112	2415 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	VPS13C	Q709C8	3753 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A0G2JMM0	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PPB8	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338		A0A1W2PRS3	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PINLYP	A6NC86	204 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	KIR3DP1	A8MWS1	328 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FCHO1	O14526	889 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	FANCG	O15287	622 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	PRKN	O60260	465 aa	Predicted RBP	11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	ITGA10	O75578	1167 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	MYO1D	O94832	1006 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	TOX	O94900	526 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	GUCA1C	O95843	209 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	AHSG	P02765	367 aa		11.13	□□□□□ -0.63
TTLL3-233	ENST00000602338	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		11.13	□□□□□ -0.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms