RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM171A2A8MVW0 826 aa20.28■□□□□ 0.84
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CAPNS1-205ENST00000588780 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
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CAPNS1-205ENST00000588780 C16orf47Q6ZP98 133 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 TRILQ7L0X0 811 aa20.24■□□□□ 0.83
CAPNS1-205ENST00000588780 ABHD13Q7L211 337 aa20.24■□□□□ 0.83
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CAPNS1-205ENST00000588780 FAM109AQ8N4B1 249 aa20.24■□□□□ 0.83
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