RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583399.5

CNDP2-222, Transcript of carnosine dipeptidase 2, human

TSL 2

Gene CNDP2, Length 601 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNDP2-222	ENST00000583399	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	LRRC34	Q8IZ02	419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	AMER3	Q8N944	861 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	TTL	Q8NG68	377 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	CCT6B	Q92526	530 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	MIEF2	Q96C03	454 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PHF21B	Q96EK2	531 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	WDR34	Q96EX3	536 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	SPSB2	Q99619	263 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	NT5DC2	Q9H857	520 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	NXT1	Q9UKK6	140 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	EMCN	Q9ULC0	261 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	MAP4K5	Q9Y4K4	846 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	TNPO3	Q9Y5L0	923 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	KCNMB2	Q9Y691	235 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	SLC22A7	Q9Y694	548 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	SPTA1	P02549	2419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	URAD	A6NGE7	173 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ARGFX	A6NJG6	315 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	TCP11X1	B4DZS4	312 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399		H0YIG0	161 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	SGK494	L7N484	410 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PROC	P04070	461 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	UMOD	P07911	640 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	FAM87A	P0C7U9	286 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	CD22	P20273	847 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	GSTM2	P28161	218 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	HNF4A	P41235	474 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	POLE2	P56282	527 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	GTF2H2	Q13888	395 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	HERC3	Q15034	1050 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	TBCC	Q15814	346 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	CCDC153	Q494R4	210 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	VWA2	Q5GFL6	755 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ABHD13	Q7L211	337 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	MKKS	Q9NPJ1	570 aa	Predicted RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	COPG2	Q9UBF2	871 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	MID2	Q9UJV3	735 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	E2F3	O00716	465 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	STX16	O14662	325 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	RDH16	O75452	317 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	WFS1	O76024	890 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	KLHL18	O94889	574 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	SERPINA6	P08185	405 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	SBK3	P0C264	359 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ALOX12	P18054	663 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PIK3CG	P48736	1102 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	SKP1	P63208	163 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	KLC1	Q07866	573 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	HYAL2	Q12891	473 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	CHAF1B	Q13112	559 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ATP1A4	Q13733	1029 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	DEFB134	Q4QY38	66 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PDSS2	Q86YH6	399 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	RDH11	Q8TC12	318 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	LRRC8C	Q8TDW0	803 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	IP6K3	Q96PC2	410 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	PAIP2	Q9BPZ3	127 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	CRB3	Q9BUF7	120 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	C12orf65	Q9H3J6	166 aa	Known RBP	12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	KLHL31	Q9H511	634 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	IPPK	Q9H8X2	491 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	ACTR8	Q9H981	624 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CNDP2-222	ENST00000583399	C14orf105	Q9NVL8	296 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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