RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 XKR6Q5GH73 641 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CRB2Q5IJ48 1285 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NIPAL1Q6NVV3 410 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CMC1Q7Z7K0 106 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PDSS2Q86YH6 399 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MMGT1Q8N4V1 131 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SIRT6Q8N6T7 355 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 Q8NA96 180 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 OR5T3Q8NGG3 340 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NT5CQ8TCD5 201 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 KIAA1191Q96A73 305 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 FAR2Q96K12 515 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 LMF1Q96S06 567 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SARGQ9BW04 601 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SLC29A3Q9BZD2 475 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SPNS1Q9H2V7 528 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ALG9Q9H6U8 611 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GPRC5BQ9NZH0 403 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ACOT9Q9Y305 439 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 IKBKGQ9Y6K9 419 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 A0A087X1B8 175 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TAPBPO15533 448 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ACSL3O95573 720 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 B3GALT4O96024 378 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 C1QAP02745 245 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SERPINA6P08185 405 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 INHBAP08476 426 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SLC35E2BP0CK96 405 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TYK2P29597 1187 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GMPRP36959 345 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SLC6A12P48065 614 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 BTN3A2P78410 334 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 IRF8Q02556 426 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 MFAP5Q13361 173 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 BMPR2Q13873 1038 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ABRAXAS2Q15018 415 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PCOLCEQ15113 449 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TLR1Q15399 786 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZKSCAN8Q15776 578 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 FAM83EQ2M2I3 478 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PAGE2BQ5JRK9 111 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CDKL4Q5MAI5 379 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 KLC3Q6P597 504 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM205Q6UW68 189 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 Q6ZS92 163 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 LANCL3Q6ZV70 420 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD37Q7Z713 158 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PACS2Q86VP3 889 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SHISA5Q8N114 240 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CYP4X1Q8N118 509 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ANKRD53Q8N9V6 530 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 GALNT11Q8NCW6 608 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CATSPER1Q8NEC5 780 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TTLQ8NG68 377 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PPP4R1Q8TF05 950 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 KCTD4Q8WVF5 259 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TBC1D20Q96BZ9 403 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NXNL1Q96CM4 212 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 C19orf60Q96EN9 201 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 UBXN10Q96LJ8 280 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PTCHD1Q96NR3 888 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 FMO2Q99518 471 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM79Q9BSE2 394 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF700Q9H0M5 742 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 VPS11Q9H270 941 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 KLHL31Q9H511 634 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ASF1BQ9NVP2 202 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 PLA2G3Q9NZ20 509 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 STMN3Q9NZ72 180 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 NINJ2Q9NZG7 142 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 TEKT2Q9UIF3 430 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRM-214ENST00000583153 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms