RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567817.5

CAPN3-217, Transcript of calpain 3, humanhuman

TSL 5

Gene CAPN3, Length 711 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3-217ENST00000567817 NUDT4Q9NZJ9 180 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ZIM2Q9NZV7 527 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 MPP6Q9NZW5 540 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 CD300AQ9UGN4 299 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 MAFFQ9ULX9 164 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 AP4B1Q9Y6B7 739 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 BPTFQ12830 3046 aa5.13□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 A0A0J9YYE9 177 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 A0A1W2PP18 115 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 CCDC162PA2VCL2 907 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 MTMR11A4FU01 709 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 CAPN8A6NHC0 703 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 PRSS29PA6NIE9 313 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 J3KR12 359 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 PDLIM1O00151 329 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 CLGNO14967 610 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ACSL4O60488 711 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 SNAP91O60641 907 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 SNX2O60749 519 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 SKAP2O75563 359 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ZMPSTE24O75844 475 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 RHOBTB1O94844 696 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 PRR35P0CG20 571 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ZCCHC18P0CG32 403 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 UROSP10746 265 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 CEACAM1P13688 526 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 PSMC3P17980 439 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 LPOP22079 712 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 GATA3P23771 443 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 FASP25445 335 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 HOXA6P31267 233 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 PTGER3P43115 390 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 KCNK10P57789 538 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 MAXP61244 160 aa5.12□□□□□ -1.59
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CAPN3-217ENST00000567817 EPS8Q12929 822 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ZNF177Q13360 481 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 UGT3A2Q3SY77 523 aa5.12□□□□□ -1.59
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CAPN3-217ENST00000567817 SLC44A4Q53GD3 710 aa5.12□□□□□ -1.59
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CAPN3-217ENST00000567817 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
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CAPN3-217ENST00000567817 ZNF382Q96SR6 550 aa5.12□□□□□ -1.59
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CAPN3-217ENST00000567817 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ANKRD60Q9BZ19 345 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 MID1IP1Q9NPA3 183 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 CCDC167Q9P0B6 97 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 FOXJ2Q9P0K8 574 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 ACTR3BQ9P1U1 418 aa5.12□□□□□ -1.59
CAPN3-217ENST00000567817 KLHL42Q9P2K6 505 aa5.12□□□□□ -1.59
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