RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566600.1

NME3-209, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 2

Gene NME3, Length 913 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-209ENST00000566600 ERI3O43414 337 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 IGHEP01854 428 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 RAB8AP61006 207 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 LCP2Q13094 533 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 IL10RAQ13651 578 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ADNP2Q6IQ32 1131 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CCNYL1Q8N7R7 359 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 OR4F6Q8NGB9 312 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 HUS1BQ8NHY5 278 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TCP10LQ8TDR4 215 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 FAM111AQ96PZ2 611 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CDK15Q96Q40 435 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ZNF382Q96SR6 550 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 MS4A8Q9BY19 250 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 RDH16O75452 317 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 IL10P22301 178 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 VWA2Q5GFL6 755 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CFAP157Q5JU67 520 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 LIPMQ5VYY2 423 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 OR51Q1Q8NH59 317 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CENPKQ9BS16 269 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ROGDIQ9GZN7 287 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SEMA3GQ9NS98 782 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PSD3Q9NYI0 1048 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 HCN3Q9P1Z3 774 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TRPS1Q9UHF7 1281 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 H3BQF6 201 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TYROBPO43914 113 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 UMODP07911 640 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TSPAN8P19075 237 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 NAGLUP54802 743 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PKNOX1P55347 436 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 KLC1Q07866 573 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 IFT88Q13099 833 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SYT16Q17RD7 645 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 FAM69BQ5VUD6 431 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 FRG2Q64ET8 278 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 EXOC3L1Q86VI1 746 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 WDR20Q8TBZ3 569 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 KCNC2Q96PR1 638 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 FRG2BQ96QU4 278 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 F2RL3Q96RI0 385 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CRB3Q9BUF7 120 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 AICDAQ9GZX7 198 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 DMRT3Q9NQL9 472 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PPT2Q9UMR5 302 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ZNF860A6NHJ4 632 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 FURINP09958 794 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CREB1P16220 341 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 OTX2P32243 289 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 XCR1P46094 333 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 BTN3A2P78410 334 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PCLAFQ15004 111 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 DEFB109BQ30KR1 87 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ABHD17CQ6PCB6 329 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 BORAQ6PGQ7 559 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 VPS50Q96JG6 964 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 OR1F2PQ96R84 312 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TBCDQ9BTW9 1192 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 GSTO2Q9H4Y5 243 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ELOVL6Q9H5J4 265 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SLC17A7Q9P2U7 560 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SNX6Q9UNH7 406 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SCN3AQ9NY46 2000 aa24.72■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PPP6CO00743 305 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 FFAR3O14843 346 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PCDH17O14917 1159 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 GPR42O15529 346 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TRIM13O60858 407 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 BMP10O95393 424 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 TGFB1P01137 390 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 CYC1P08574 325 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 MMP11P24347 488 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 ARFIP1P53367 373 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 PLA2G16P53816 162 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 DEPDC1Q5TB30 811 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 LETMD1Q6P1Q0 360 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-209ENST00000566600 SHISA6Q6ZSJ9 500 aa24.71■■□□□ 1.55
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