RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563200.5

PPP4C-205, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 5

Gene PPP4C, Length 1,447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-205	ENST00000563200	WWOX	Q9NZC7	414 aa		20.49	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	DYTN	A2CJ06	578 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	HMX2	A2RU54	273 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	STK16	O75716	305 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	HSPA7	P48741	367 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	GRHL3	Q8TE85	626 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	WDR34	Q96EX3	536 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SEC16B	Q96JE7	1060 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PITHD1	Q9GZP4	211 aa	Predicted RBP	20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	AGPAT4	Q9NRZ5	378 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	IGSF5	Q9NSI5	407 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ASB1	Q9Y576	335 aa		20.48	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	AGFG2	O95081	481 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	WDPCP	O95876	746 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	EPOR	P19235	508 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	JAK1	P23458	1154 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	GSTM2	P28161	218 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CRABP2	P29373	138 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SLMAP	Q14BN4	828 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	BTBD16	Q32M84	506 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	SFT2D3	Q587I9	215 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	RELL1	Q8IUW5	271 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	MMGT1	Q8N4V1	131 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TTL	Q8NG68	377 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	OR1N1	Q8NGS0	311 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CD274	Q9NZQ7	290 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF112	Q9ULX5	631 aa		20.47	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPE	Q02224	2701 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	LRIT2	A6NDA9	550 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	E2F3	O00716	465 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	CD22	P20273	847 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	E2F2	Q14209	437 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	UBAP2	Q5T6F2	1119 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	KRT78	Q8N1N4	520 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	PRR7	Q8TB68	274 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	M1AP	Q8TC57	530 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	FAR1	Q8WVX9	515 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ATOH8	Q96SQ7	321 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ALG9	Q9H6U8	611 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	MMP25	Q9NPA2	562 aa		20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	20.46	■□□□□ 0.87
PPP4C-205	ENST00000563200	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	TRAV17	A0A0B4J275	112 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	BLACE	A4D250	179 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	B4GALT2	O60909	372 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CLEC3A	O75596	197 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	F10	P00742	488 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	RNF224	P0DH78	156 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	TFEB	P19484	476 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	STXBP1	P61764	594 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	BTG2	P78543	158 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	EXT1	Q16394	746 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PDK4	Q16654	411 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	RAPH1	Q70E73	1250 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CENPL	Q8N0S6	344 aa	Predicted RBP	20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CA13	Q8N1Q1	262 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	NOA1	Q8NC60	698 aa	Known RBP	20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	LPAR4	Q99677	370 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	NPAS2	Q99743	824 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CD244	Q9BZW8	370 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	STMN3	Q9NZ72	180 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	NINJ2	Q9NZG7	142 aa		20.45	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	KERA	O60938	352 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF33B	Q06732	778 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	DOC2A	Q14183	400 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	TAAR6	Q96RI8	345 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	SLX1A	Q9BQ83	275 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	FUT8	Q9BYC5	575 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	RHBG	Q9H310	441 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	NUDT4	Q9NZJ9	180 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	DIDO1	Q9BTC0	2240 aa	Known RBP	20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	OR5H15	A6NDH6	313 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200		A8MUI8	341 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	FAM227A	F5H4B4	570 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	CLGN	O14967	610 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	PRMT3	O60678	531 aa		20.44	■□□□□ 0.86
PPP4C-205	ENST00000563200	MTHFD2	P13995	350 aa		20.44	■□□□□ 0.86

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