RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558394.5

TSPAN3-204, Transcript of tetraspanin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TSPAN3, Length 550 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN3-204ENST00000558394 CRIM1Q9NZV1 1036 aa16.61■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 KCMF1Q9P0J7 381 aa16.61■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 PAK5Q9P286 719 aa16.61■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 Q9UFV3 132 aa16.61■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ACAD8Q9UKU7 415 aa16.61■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 A6NNC1 897 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC16A5O15375 505 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 NDUFS4O43181 175 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 RAF1P04049 648 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 INHBBP09529 407 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ALOX12P18054 663 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 OGNP20774 298 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 BTG2P78543 158 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 NDUFAF5Q5TEU4 345 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 PAMR1Q6UXH9 720 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ABHD13Q7L211 337 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 TBC1D19Q8N5T2 526 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 MFSD9Q8NBP5 474 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF740Q8NDX6 193 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 B3GNT7Q8NFL0 401 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 MFSD3Q96ES6 412 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ATG10Q9H0Y0 220 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 PRDM9Q9NQV7 894 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ALKBH4Q9NXW9 302 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 B4GALT7Q9UBV7 327 aa16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 GRID2IPA4D2P6 1211 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 GFYI3L273 518 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 LIASO43766 372 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 CEP104O60308 925 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 WDR1O75083 606 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ETS1P14921 441 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 MAOAP21397 527 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 CLCN7P51798 805 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 RGS1Q08116 209 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 HYAL2Q12891 473 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 DEFB113Q30KQ7 82 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 FLYWCH1Q4VC44 716 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 CES3Q6UWW8 571 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 GK5Q6ZS86 529 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 KIAA0408Q6ZU52 694 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 PRUNE1Q86TP1 453 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 GPALPP1Q8IXQ4 340 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 SYCE1Q8N0S2 351 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 NFAM1Q8NET5 270 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 WFDC11Q8NEX6 87 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 OR2M7Q8NG81 312 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 NUDT8Q8WV74 236 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ASB15Q8WXK1 588 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 LDAHQ9H6V9 325 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 EXO5Q9H790 373 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 ZDHHC11Q9H8X9 412 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 SAMD15Q9P1V8 674 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM215AQ9Y5M1 114 aa16.59■□□□□ 0.25
TSPAN3-204ENST00000558394 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 CTAGE9A4FU28 777 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 BTNL10A8MVZ5 291 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 OR1F1O43749 312 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 MYO1DO94832 1006 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 CDH1P12830 882 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 PAMP19021 973 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 CCND1P24385 295 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 ARNTP27540 789 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 NR0B1P51843 470 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 BASP1P80723 227 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 PWP1Q13610 501 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 C1orf185Q5T7R7 199 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 WLSQ5T9L3 541 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 TMEM198Q66K66 360 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 LIX1LQ8IVB5 337 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 PALM2Q8IXS6 379 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 LRRC57Q8N9N7 239 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 FAM222BQ8WU58 562 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 SARAFQ96BY9 339 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 VMP1Q96GC9 406 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 SLC30A3Q99726 388 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 KIFC1Q9BW19 673 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 TTTY12Q9BZ98 90 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 RHBGQ9H310 441 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 DMRT3Q9NQL9 472 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 EIF2B3Q9NR50 452 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 DEPPQ9NTK1 212 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 KLHL42Q9P2K6 505 aa16.58■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 URADA6NGE7 173 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 AVILO75366 819 aa16.57■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
TSPAN3-204ENST00000558394 RNH1P13489 461 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.2 ms