RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551984.5

FGD4-215, Transcript of FYVE, RhoGEF and PH domain containing 4, human

TSL 5

Gene FGD4, Length 2,435 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FGD4-215	ENST00000551984	TIMM29	Q9BSF4	260 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	LDHAL6B	Q9BYZ2	381 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	GPR63	Q9BZJ6	419 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SPRY4	Q9C004	299 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	OR2AG1	Q9H205	316 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	OCIAD1	Q9NX40	245 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CPNE7	Q9UBL6	633 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SUCO	Q9UBS9	1254 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC23A2	Q9UGH3	650 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TESMIN	Q9Y4I5	508 aa		6.25	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MN1	Q10571	1320 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	STMND1	H3BQB6	276 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	DYRK3	O43781	588 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PMPCB	O75439	489 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	VAPB	O95292	243 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KRT6A	P02538	564 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KRT6B	P04259	564 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	NFKB1	P19838	968 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CSTF2	P33240	577 aa	Known RBP eCLIP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HMGCL	P35914	325 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	YAP1	P46937	504 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	WNT3A	P56704	352 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	STX1B	P61266	288 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MC2R	Q01718	297 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CDC20	Q12834	499 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MERTK	Q12866	999 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	AQP6	Q13520	282 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	LY6D	Q14210	128 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MAPK11	Q15759	364 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	NPTX1	Q15818	432 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SMU1	Q2TAY7	513 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC36A3	Q495N2	470 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	GTF2IRD2B	Q6EKJ0	949 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	WASH2P	Q6VEQ5	465 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	BBS12	Q6ZW61	710 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	UTS2B	Q765I0	119 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	C11orf96	Q7Z7L8	435 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	GTF2IRD2	Q86UP8	949 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC51B	Q86UW2	128 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	VASH2	Q86V25	355 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	LRRTM4	Q86VH4	590 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ARMC8	Q8IUR7	673 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF547	Q8IVP9	402 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	C10orf107	Q8IVU9	208 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	OFCC1	Q8IZS5	231 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF567	Q8N184	647 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MFSD4A	Q8N468	514 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	EXD3	Q8N9H8	876 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ACTL9	Q8TC94	416 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	NKD1	Q969G9	470 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	POM121	Q96HA1	1249 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	AHCYL2	Q96HN2	611 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	FBXL20	Q96IG2	436 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PCDHAC1	Q9H158	963 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	C12orf10	Q9HB07	376 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	FANCE	Q9HB96	536 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PRDM8	Q9NQV8	689 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	IL17C	Q9P0M4	197 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF229	Q9UJW7	825 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	B3GALT1	Q9Y5Z6	326 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	LOC100996750	A0A140TA64	210 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	EFCAB7	A8K855	629 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984		H7C0C1	242 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	AGRP	O00253	132 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PLIN3	O60664	434 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TIPRL	O75663	272 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	C9	P02748	559 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ANKRD34C	P0C6C1	535 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	M6PR	P20645	277 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	MPST	P25325	297 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SLC7A1	P30825	629 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	PTPN7	P35236	360 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CASP3	P42574	277 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ABCE1	P61221	599 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	GALK2	Q01415	458 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HSPA14	Q0VDF9	509 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	NFATC2	Q13469	925 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HERC3	Q15034	1050 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	AGAP9	Q5VTM2	703 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZDHHC20	Q5W0Z9	365 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ZNF605	Q86T29	641 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	EPHX4	Q8IUS5	362 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	DEPDC4	Q8N2C3	294 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	CBR4	Q8N4T8	237 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	ANKFN1	Q8N957	763 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	SNX31	Q8N9S9	440 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	HTR3C	Q8WXA8	447 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	S100Z	Q8WXG8	99 aa		6.24	□□□□□ -1.41
FGD4-215	ENST00000551984	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41

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