RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 PIK3CBP42338 1070 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 RAP1GDS1P52306 607 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 HSD17B7P56937 341 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP5.3□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 VPS11Q9H270 941 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 ACTR8Q9H981 624 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF160Q9HCG1 818 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 PRDM9Q9NQV7 894 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.3□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.3□□□□□ -1.568e-6■■■□□ 14.7
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CLSTN3-215ENST00000544584 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa5.3□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 A0A1W2PQ72 361 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 ESYT3A0FGR9 886 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 ARHGAP10A1A4S6 786 aa5.29□□□□□ -1.56
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CLSTN3-215ENST00000544584 H3BQF6 201 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 SGK494L7N484 410 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 TP73O15350 636 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 ERI3O43414 337 aaKnown RBP5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 FOXS1O43638 330 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 RDH16O75452 317 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 C2P06681 752 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 TUBBP07437 444 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 GSTA1P08263 222 aa5.29□□□□□ -1.56
CLSTN3-215ENST00000544584 ABHD2P08910 425 aa5.29□□□□□ -1.56
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