RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533557.5

BBS1-222, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 2

Gene BBS1, Length 1,043 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-222	ENST00000533557	MAGEA1	P43355	309 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	DCAF7	P61962	342 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FOXO1	Q12778	655 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	P3H1	Q32P28	736 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	DEFB134	Q4QY38	66 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	AARS2	Q5JTZ9	985 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	C1orf185	Q5T7R7	199 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ASPG	Q86U10	573 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TMEM156	Q8N614	296 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ASB11	Q8WXH4	323 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ALKBH4	Q9NXW9	302 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	UTP6	Q9NYH9	597 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ANAPC5	Q9UJX4	755 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FBXW2	Q9UKT8	454 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	DRG1	Q9Y295	367 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SBDS	Q9Y3A5	250 aa	Known RBP eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	EML6	Q6ZMW3	1958 aa		11.27	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	OR14I1	A6ND48	311 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	C4orf51	C9J302	202 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	GFY	I3L273	518 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FCHO1	O14526	889 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	BCKDK	O14874	412 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	MFAP3L	O75121	409 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TJP3	O95049	919 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SYF2	O95926	243 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TUBB4A	P04350	444 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	IL10	P22301	178 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TACR1	P25103	407 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	HSD17B2	P37059	387 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SKIV2L2	P42285	1042 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CLCN7	P51798	805 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PLGLB1	Q02325	96 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CUL1	Q13616	776 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	RPS6KA1	Q15418	735 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	RIPPLY2	Q5TAB7	128 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	THEMIS2	Q5TEJ8	643 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PAOX	Q6QHF9	649 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	IL20RB	Q6UXL0	311 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PPP1R21	Q6ZMI0	780 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	LRRC6	Q86X45	466 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FBXO15	Q8NCQ5	510 aa	Predicted RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ATG4A	Q8WYN0	398 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CAPZA3	Q96KX2	299 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TIMMDC1	Q9NPL8	285 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ZNHIT6	Q9NWK9	470 aa	Known RBP	11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ZFAT	Q9P243	1243 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	KIAA1549	Q9HCM3	1950 aa		11.26	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6AP2	A0A1C7CYW4	349 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	AQP7	O14520	342 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ATP6AP2	O75787	350 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	OR2J2	O76002	312 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	EPX	P11678	715 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CHRM3	P20309	590 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	POU4F3	Q15319	338 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PCBP2	Q15366	365 aa	Known RBP eCLIP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PCID2	Q5JVF3	399 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	QSOX2	Q6ZRP7	698 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CENPU	Q71F23	418 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PRELID2	Q8N945	189 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	B3GNT7	Q8NFL0	401 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TNIP2	Q8NFZ5	429 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PEX13	Q92968	403 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	RNASE6	Q93091	150 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	THAP11	Q96EK4	314 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	MFSD3	Q96ES6	412 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	AICDA	Q9GZX7	198 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	FAM114A2	Q9NRY5	505 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ACAD8	Q9UKU7	415 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	EDAR	Q9UNE0	448 aa		11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	PPIE	Q9UNP9	301 aa	Known RBP	11.25	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM64	A6NGJ6	449 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	TRIM64B	A6NI03	449 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ERI2	A8K979	691 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	WDR1	O75083	606 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	MYO1D	O94832	1006 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	VAPB	O95292	243 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	HRG	P04196	525 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	CDH1	P12830	882 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	ALOX12	P18054	663 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	BMP5	P22003	454 aa		11.24	□□□□□ -0.61
BBS1-222	ENST00000533557	SOX3	P41225	446 aa		11.24	□□□□□ -0.61

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