RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	CCR8	P51685	355 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TAS2R50	P59544	299 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CSNK1G2	P78368	415 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MPP1	Q00013	466 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF33B	Q06732	778 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PWP1	Q13610	501 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SLMAP	Q14BN4	828 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TRADD	Q15628	312 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SYT16	Q17RD7	645 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	BTBD16	Q32M84	506 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	HSP90AA5P	Q58FG0	334 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SPANXN3	Q5MJ09	141 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	RNASEH2B	Q5TBB1	312 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MFSD4B	Q5TF39	518 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	H3F3C	Q6NXT2	135 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	AGTRAP	Q6RW13	159 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PLD3	Q8IV08	490 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC5A8	Q8N695	610 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ZBTB9	Q96C00	473 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	STMN4	Q9H169	189 aa	Predicted RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MMP25	Q9NPA2	562 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ABCF3	Q9NUQ8	709 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	STMN3	Q9NZ72	180 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PDE10A	Q9Y233	779 aa		11.29	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SEC24D	O94855	1032 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	HAUS5	O94927	633 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	F10	P00742	488 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	IL1RN	P18510	177 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MST1	P26927	711 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	LSP1	P33241	339 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CORO7	P57737	925 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	IL2	P60568	153 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP2R2A	P63151	447 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	IFFO1	Q0D2I5	559 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PPP1R7	Q15435	360 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	C3AR1	Q16581	482 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MEP1A	Q16819	746 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	KRT71	Q3SY84	523 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF766	Q5HY98	468 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ACER2	Q5QJU3	275 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM178A	Q8NBL3	297 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MFSD9	Q8NBP5	474 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	EEF1AKMT1	Q8WVE0	214 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	LPAR4	Q99677	370 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	IARS2	Q9NSE4	1012 aa	Known RBP	11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TINAG	Q9UJW2	476 aa		11.28	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	DNHD1	Q96M86	4753 aa		11.27	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ACAN	P16112	2415 aa		11.27	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TRBC2	A0A5B9	178 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	URAD	A6NGE7	173 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NDUFAB1	O14561	156 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM155B	O75949	473 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CELA2A	P08217	269 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CCT5	P48643	541 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	EFNA3	P52797	238 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CAV1	Q03135	178 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	RGS1	Q08116	209 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PDAP1	Q13442	181 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	NAE1	Q13564	534 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	LANCL3	Q6ZV70	420 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ABHD13	Q7L211	337 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	OR56A3	Q8NH54	315 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	TLCD1	Q96CP7	247 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC39	Q96DD0	335 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	LINGO1	Q96FE5	620 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	CERS2	Q96G23	380 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	UTP23	Q9BRU9	249 aa	Known RBP	11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	RASSF4	Q9H2L5	321 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	KCNK13	Q9HB14	408 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ARL15	Q9NXU5	204 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	WHRN	Q9P202	907 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		11.27	□□□□□ -0.61
CSRP1-213	ENST00000530120	SNX24	Q9Y343	169 aa		11.27	□□□□□ -0.61

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