RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 NSL1Q96IY1 281 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 AP1M1Q9BXS5 423 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PAIP1Q9H074 479 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 DNAJC18Q9H819 358 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PSTPIP2Q9H939 334 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 VAT1LQ9HCJ6 419 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 POLD4Q9HCU8 107 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 HAUS2Q9NVX0 235 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D7Q9P0N9 293 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 GAGE2DQ9UEU5 116 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 PNMA2Q9UL42 364 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 ODF2LQ9ULJ1 636 aa4.09□□□□□ -1.75
SGCE-211ENST00000522045 LTBP4Q8N2S1 1624 aa4.09□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GUA9 196 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RSPH10B2B2RC85 870 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MSH4O15457 936 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RIPK2O43353 540 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SNX3O60493 162 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ATP6V1G2O95670 118 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SHBGP04278 402 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2ABP04908 130 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RSPH10BP0C881 870 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 DNAH10OSP0CZ25 163 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 EZRP15311 586 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 HIST1H2ADP20671 130 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MAN1A1P33908 653 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 NF2P35240 595 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PIK3CAP42336 1068 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 MAGEA11P43364 429 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 RPL21P46778 160 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ENPEPQ07075 957 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 LGALS3BPQ08380 585 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 BFSP1Q12934 665 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CRYMQ14894 314 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CBWD6Q4V339 395 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 EPC2Q52LR7 807 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 C2CD6Q53TS8 623 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CMPK2Q5EBM0 449 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CBWD3Q5JTY5 395 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 SEL1L2Q5TEA6 688 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PRR5LQ6MZQ0 368 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 C1orf186Q6ZWK4 172 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.08□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 CCDC63Q8NA47 563 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CFAP61Q8NHU2 1237 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 TBC1D16Q8TBP0 767 aa4.08□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 ART4Q93070 314 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ZNF414Q96IQ9 312 aa4.08□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD27Q96NW4 1050 aa4.08□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 DPH5Q9H2P9 285 aa4.08□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 PARVGQ9HBI0 331 aa4.08□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 RNF186Q9NXI6 227 aa4.08□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 GTF3C4Q9UKN8 822 aa4.08□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 ATP6V0E1O15342 81 aa4.07□□□□□ -1.76
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SGCE-211ENST00000522045 BBOX1O75936 387 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ABHD2P08910 425 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 GZMAP12544 262 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 CCNB1P14635 433 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 NQO1P15559 274 aaKnown RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 ATP5DP30049 168 aa4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 COILP38432 576 aaPredicted RBP4.07□□□□□ -1.76
SGCE-211ENST00000522045 PBX3P40426 434 aa4.07□□□□□ -1.76
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