RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510173.6

RBM4-208, Transcript of RNA binding motif protein 4, human

TSL 3

Gene RBM4, Length 782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4-208	ENST00000510173	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	KRTCAP3	Q53RY4	240 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	PAQR3	Q6TCH7	311 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	ABHD13	Q7L211	337 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	SLC26A11	Q86WA9	606 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	BEST3	Q8N1M1	668 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	UHMK1	Q8TAS1	419 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	MAGED4	Q96JG8	741 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	ROPN1B	Q9BZX4	212 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	ROPN1	Q9HAT0	212 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	CLK4	Q9HAZ1	481 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	MOCS1	Q9NZB8	636 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	FETUB	Q9UGM5	382 aa		13.46	□□□□□ -0.25
RBM4-208	ENST00000510173	MDC1	Q14676	2089 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	HEATR5B	Q9P2D3	2071 aa		13.46	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TRBC2	A0A5B9	178 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	CCL21	O00585	134 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	OR1F1	O43749	312 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	FH	P07954	510 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	NPPB	P16860	134 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ALOX12	P18054	663 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	EFNA3	P52797	238 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TUBA3C	Q13748	450 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	PHKG1	Q16816	387 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	FAM45BP	Q6NSW5	357 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TUBA3E	Q6PEY2	450 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	MBOAT1	Q6ZNC8	495 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	KCT2	Q8NC54	265 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	FAM45A	Q8TCE6	357 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	THAP3	Q8WTV1	239 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	PEX11G	Q96HA9	241 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TMEM109	Q9BVC6	243 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	PLAC1	Q9HBJ0	212 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TXNDC16	Q9P2K2	825 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		13.45	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	FAM159B	A6NKW6	160 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	SLC19A2	O60779	497 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	INHBA	P08476	426 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ESRRA	P11474	423 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	MST1	P26927	711 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	PTGER4	P35408	488 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	AHR	P35869	848 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	MSH2	P43246	934 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	SMS	P52788	366 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	CDKN2D	P55273	166 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	OR4D2	P58180	307 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	RHAG	Q02094	409 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	OC90	Q02509	493 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	CSHL1	Q14406	222 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	USP10	Q14694	798 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	OR1C1	Q15619	314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	XKRX	Q6PP77	449 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TAOK1	Q7L7X3	1001 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	PDSS2	Q86YH6	399 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	CRLF3	Q8IUI8	442 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	EID3	Q8N140	333 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	RIBC1	Q8N443	379 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	MDS2	Q8NDY4	140 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ARMC2	Q8NEN0	867 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	TRPV3	Q8NET8	790 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	OR4K1	Q8NGD4	311 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	OR56A3	Q8NH54	315 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	NT5C	Q8TCD5	201 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ITLN2	Q8WWU7	325 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	SLC5A11	Q8WWX8	675 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	FBXL8	Q96CD0	374 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	CCDC120	Q96HB5	630 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ZIM3	Q96PE6	472 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	SH2B3	Q9UQQ2	575 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	CACNA1D	Q01668	2161 aa		13.44	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	ZGRF1	Q86YA3	2104 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	GABRR3	A8MPY1	467 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	PSMD12	O00232	456 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBM4-208	ENST00000510173	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26

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