RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504431.1

UBE2B-204, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 235 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-204ENST00000504431 TREX1Q9NSU2 369 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SERTAD4Q9NUC0 356 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 BFARQ9NZS9 450 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 FOXJ2Q9P0K8 574 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 WDR37Q9Y2I8 494 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SPEGQ15772 3267 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 UNC13CQ8NB66 2214 aa7.23□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 KIF26BQ2KJY2 2108 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 FAM234BA2RU67 622 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SDR42E2A6NKP2 422 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 IQCF5A8MTL0 148 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 CHUKO15111 745 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TP73O15350 636 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PIAS1O75925 651 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PYGLP06737 847 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 EBLN1P0CF75 366 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ALPPL2P10696 532 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 HGFP14210 728 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF7P17097 686 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 CKMT2P17540 419 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TYRP1P17643 537 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 FOXN2P32314 431 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 HADHAP40939 763 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 MAGEA6P43360 314 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PRAMEP78395 509 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 PDE1BQ01064 536 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 CACNG1Q06432 222 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ST3GAL2Q16842 350 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TBC1D25Q3MII6 688 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ZNF789Q5FWF6 425 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 LDLRAP1Q5SW96 308 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 LRRTM4Q86VH4 590 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 KRT222Q8N1A0 295 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ARL14Q8N4G2 192 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 DDHD1Q8NEL9 900 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 OR4L1Q8NH43 312 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ABHD5Q8WTS1 349 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SLCO2A1Q92959 643 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 CFAP36Q96G28 342 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 DCUN1D1Q96GG9 259 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 RANBP9Q96S59 729 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 DUSP26Q9BV47 211 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 KIFC1Q9BW19 673 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 IL22Q9GZX6 179 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 VPS18Q9P253 973 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SLC17A6Q9P2U8 582 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 RNF14Q9UBS8 474 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 STEAP1Q9UHE8 339 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 ANAPC5Q9UJX4 755 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 APPL1Q9UKG1 709 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 KLK13Q9UKR3 277 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 SLC39A10Q9ULF5 831 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 RNF215Q9Y6U7 377 aa7.22□□□□□ -1.25
UBE2B-204ENST00000504431 OR52A4PA6NMU1 304 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 LINC00473A8K010 186 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 AGAP14A8MT82 685 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 PDZK1P1A8MUH7 402 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 QSOX1O00391 747 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 KMOO15229 486 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 VEGFDO43915 354 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 PPFIA2O75334 1257 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 NPSP0C0P6 89 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ERVK-10P10266 1014 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 CKMT1AP12532 417 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ALDH4A1P30038 563 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ELK3P41970 407 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ABCG1P45844 678 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 MAPK9P45984 424 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 PGGT1BP53609 377 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 OR1D5P58170 312 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 CCL7P80098 99 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 SARNPP82979 210 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 KRT72Q14CN4 511 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 MAPKAPK3Q16644 382 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 AMZ1Q400G9 498 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ANKRD20A4Q4UJ75 823 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 PDPK2PQ6A1A2 396 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 KIAA0408Q6ZU52 694 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 DENND6AQ8IWF6 608 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 CCDC28AQ8IWP9 274 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 CFAP206Q8IYR0 622 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 ARL10Q8N8L6 244 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 MCUQ8NE86 351 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 LKAAEAR1Q8TD35 194 aa7.21□□□□□ -1.26
UBE2B-204ENST00000504431 SLC37A2Q8TED4 501 aa7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26 ms