RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498399.1

TIMMDC1-209, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene TIMMDC1, Length 684 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPSB3Q6PJ21 355 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 RHBDF2Q6PJF5 856 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM270Q6UE05 265 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPATA21Q7Z572 469 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF677Q86XU0 584 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 NRROSQ86YC3 692 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 WDR49Q8IV35 697 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 FAM71AQ8IYT1 594 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 KIF2BQ8N4N8 673 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MCUQ8NE86 351 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CFAP61Q8NHU2 1237 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPTC7Q8NI37 304 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 FBXO25Q8TCJ0 367 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAS1R2Q8TE23 839 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF653Q96CK0 615 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SCMH1Q96GD3 660 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SERPINB12Q96P63 405 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM237Q96Q45 408 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SMC6Q96SB8 1091 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCYT2Q99447 389 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 DDOQ99489 341 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEMA3CQ99985 751 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 THAP2Q9H0W7 228 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PCDH9Q9HC56 1237 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MRPL47Q9HD33 250 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 WSB2Q9NYS7 404 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C1RLQ9NZP8 487 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MALT1Q9UDY8 824 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 RASAL2Q9UJF2 1139 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PADI1Q9ULC6 663 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MTUS1Q9ULD2 1270 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLAGL1Q9UM63 463 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ICAM5Q9UMF0 924 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPIEQ9UNP9 301 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ALG6Q9Y672 507 aa3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 COL1A2P08123 1366 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 LOC100509620A0A075B734 347 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TMEM120BA0PK00 339 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 LNP1A1A4G5 178 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SYNDIG1LA6NDD5 238 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GLOD5A6NK44 160 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 KCNN4O15554 427 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PLOD3O60568 738 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PEX11AO75192 247 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF432O94892 652 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 KDM4BO94953 1096 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 LUC7L3O95232 432 aaKnown RBP3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PIGRP01833 764 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF286BP0CG31 522 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MYBL1P10243 752 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MCF2P10911 925 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 TAC1P20366 129 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CYP2B6P20813 491 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 UGT1A1P22309 533 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CALB2P22676 271 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 IVDP26440 423 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDC25CP30307 473 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 FOXN2P32314 431 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 COILP38432 576 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 IFNAR2P48551 515 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 RWDD2BP57060 319 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 PPP2R2BQ00005 443 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CDR2Q01850 454 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GCNT1Q02742 428 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CUL2Q13617 745 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 KRT33BQ14525 404 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF699Q32M78 642 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANKRD20A2Q5SQ80 823 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANKRD20A1Q5TYW2 823 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ANKRD20A3Q5VUR7 823 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 GARNL3Q5VVW2 1013 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MFSD14CQ5VZR4 134 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C18orf63Q68DL7 685 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 C11orf63Q6NUN7 778 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC30A6Q6NXT4 461 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC39A4Q6P5W5 647 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CATSPER4Q7RTX7 472 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 CUZD1Q86UP6 607 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ZNF410Q86VK4 478 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SLC47A2Q86VL8 602 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ECHDC2Q86YB7 292 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 MFN1Q8IWA4 741 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 EMC1Q8N766 993 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 AVL9Q8NBF6 648 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 ACVR1CQ8NER5 493 aa3.95□□□□□ -1.78
TIMMDC1-209ENST00000498399 SPATA3Q8NHX4 192 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.4 ms