RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491123.5

SUCLG1-208, Transcript of succinate-CoA ligase alpha subunit, human

TSL 3

Gene SUCLG1, Length 1,073 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SUCLG1-208	ENST00000491123	TJP1	Q07157	1748 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	C5	P01031	1676 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	PAPPA	Q13219	1627 aa		2.79	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	NPC1L1	Q9UHC9	1359 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	PCDH11X	Q9BZA7	1347 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A087X0M5	115 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123		A0A1B0GX30	115 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	TIMM44	O43615	452 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	RTN3	O95197	1032 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	ALOX5	P09917	674 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRKAR2B	P31323	418 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	CKAP4	Q07065	602 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRKG2	Q13237	762 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	TST	Q16762	297 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	TIMM50	Q3ZCQ8	353 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	GPR33	Q49SQ1	333 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPATA1	Q5VX52	437 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	CFAP161	Q6P656	301 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	FCRLA	Q7L513	359 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	TEX11	Q8IYF3	940 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	AVL9	Q8NBF6	648 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	RFFL	Q8WZ73	363 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	CFAP53	Q96M91	514 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	C7orf26	Q96N11	449 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	TREX2	Q9BQ50	279 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	TBC1D17	Q9HA65	648 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPS6KL1	Q9Y6S9	549 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	RGPD3	A6NKT7	1758 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	RGPD4	Q7Z3J3	1758 aa		2.78	□□□□□ -1.96
SUCLG1-208	ENST00000491123	CASZ1	Q86V15	1759 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	C4B	P0C0L5	1744 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	ADAMTS7	Q9UKP4	1686 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMEM63A	O94886	807 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	ATP1B1	P05026	303 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	UMPS	P11172	480 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	DCAF7	P61962	342 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRPX	P78539	464 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	SRSF9	Q13242	221 aa	Known RBP eCLIP	2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC39A6	Q13433	755 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	C1orf141	Q5JVX7	400 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	KLHL35	Q6PF15	583 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	MCM10	Q7L590	875 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	CCDC89	Q8N998	374 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	OR4D10	Q8NGI6	311 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	POMGNT1	Q8WZA1	660 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	CMTM3	Q96MX0	182 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	OLA1	Q9NTK5	396 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	IRAK4	Q9NWZ3	460 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	NRBP1	Q9UHY1	535 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	PLEKHA6	Q9Y2H5	1048 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMED3	Q9Y3Q3	217 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	MRC1	P22897	1456 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	UBR2	Q8IWV8	1755 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	C4A	P0C0L4	1744 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	KDR	P35968	1356 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	PALLD	Q8WX93	1383 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	MAP3K5	Q99683	1374 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	LNP1	A1A4G5	178 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	GLTPD2	A6NH11	291 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	ARPC2	O15144	300 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	ACSL1	P33121	698 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	WDR43	Q15061	677 aa	Known RBP eCLIP	2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	SH2D4A	Q9H788	454 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	KCNMB3	Q9NPA1	279 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	NUDC	Q9Y266	331 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	KCP	Q6ZWJ8	1503 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	BCL9	O00512	1426 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	MAPK8IP3	Q9UPT6	1336 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	SPRR5	A0A1B0GTR4	108 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	PGPEP1L	A6NFU8	196 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123		K7EQG2	157 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRAMEF11	O60813	436 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	HSPA1A	P0DMV8	641 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	HSPA1B	P0DMV9	641 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	CHM	P24386	653 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	ZNF133	P52736	654 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	CLNS1A	P54105	237 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	SIRPA	P78324	504 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SUCLG1-208	ENST00000491123	PRAME	P78395	509 aa		2.75	□□□□□ -1.97

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms