RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM71DQ8N9W8 422 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 GLB1L3Q8NCI6 653 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 OR13J1Q8NGT2 312 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC35B2Q8TB61 432 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF285Q96NJ3 590 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM118BQ9BPY3 351 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ANP32EQ9BTT0 268 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 HGH1Q9BTY7 390 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 AP1M1Q9BXS5 423 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC26A1Q9H2B4 701 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 LRRC40Q9H9A6 602 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CASS4Q9NQ75 786 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 DHCR7Q9UBM7 475 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 RIMKLBQ9ULI2 386 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 EDARQ9UNE0 448 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PLCL2Q9UPR0 1127 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 CDYLQ9Y232 598 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 ASF1AQ9Y294 204 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 NTNG1Q9Y2I2 539 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PADI2Q9Y2J8 665 aa6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PRPF40A-210ENST00000489741 APCP25054 2843 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC162PA2VCL2 907 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 GRID2IPA4D2P6 1211 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OR51F1A6NGY5 319 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 VSTM2BA6NLU5 285 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 AGPSO00116 658 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 MASP2O00187 686 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PSMD3O43242 534 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OR1I1O60431 355 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 KLHL41O60662 606 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SUN1O94901 812 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FTH1P02794 183 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CPEP16870 476 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PTMSP20962 102 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 MMP11P24347 488 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PKLRP30613 574 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OTX2P32243 289 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CCR7P32248 378 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 DCTP40126 519 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC25A3Q00325 362 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ACVR1Q04771 509 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SPA17Q15506 151 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 RABL3Q5HYI8 236 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CCDC181Q5TID7 509 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 C1orf189Q5VU69 101 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FCRL6Q6DN72 434 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 NAPRTQ6XQN6 538 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF534Q76KX8 674 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 COX15Q7KZN9 410 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CUZD1Q86UP6 607 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TMTC1Q8IUR5 882 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC22A15Q8IZD6 547 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CLEC1AQ8NC01 280 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FKBP10Q96AY3 582 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 RAX2Q96IS3 184 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PANX2Q96RD6 677 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SLC29A3Q9BZD2 475 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM8Q9BZR9 551 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TSPY26PQ9H489 355 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 WDR54Q9H977 334 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 EURLQ9NYK6 297 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 KLK4Q9Y5K2 254 aa6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CACNA1DQ01668 2161 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 A1L4Q6 167 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ANKUB1A6NFN9 424 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TARM1B6A8C7 271 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 PEX12O00623 359 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SOCS6O14544 535 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 TMEM127O75204 238 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 SLCO2B1O94956 709 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ALPPP05187 535 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 OR56A5P0C7T3 313 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 MAGP20916 626 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 STIP1P31948 543 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 FOLR3P41439 243 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 RAB28P51157 221 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 ARSFP54793 590 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-210ENST00000489741 POU6F1Q14863 301 aa6.07□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.4 ms