RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 OR8H3Q8N146 312 aa12.97□□□□□ -0.33
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NISCH-212ENST00000488380 PDE9AO76083 593 aa12.95□□□□□ -0.34
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NISCH-212ENST00000488380 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 CSKP41240 450 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 GPR19Q15760 415 aa12.95□□□□□ -0.34
NISCH-212ENST00000488380 SLC8B1Q6J4K2 584 aa12.95□□□□□ -0.34
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