RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485532.1

PRAME-212, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 709 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN12O95859 305 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 AHSGP02765 367 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 C8GP07360 202 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ICAM2P13598 275 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MSH2P43246 934 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OLR1P78380 273 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RHAGQ02094 409 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TUBA3CQ13748 450 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 INAQ16352 499 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 KRT71Q3SY84 523 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SFT2D3Q587I9 215 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZNF766Q5HY98 468 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ACER2Q5QJU3 275 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TUBA3EQ6PEY2 450 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ADGRD1Q6QNK2 874 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TMEM207Q6UWW9 146 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 KIAA0408Q6ZU52 694 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 STRA8Q7Z7C7 330 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TDRPQ86YL5 185 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CRLF3Q8IUI8 442 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 LMNTD2Q8IXW0 634 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MYO1HQ8N1T3 1032 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CAMKVQ8NCB2 501 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SUN3Q8TAQ9 357 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SLC13A3Q8WWT9 602 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CCDC120Q96HB5 630 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OR4K3Q96R72 315 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CPNE1Q99829 537 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PPCSQ9HAB8 311 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 KCNK13Q9HB14 408 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 LANCL2Q9NS86 450 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TAS2R13Q9NYV9 303 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 IKZF3Q9UKT9 509 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ENTPD4Q9Y227 616 aa11.89□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PCNX1Q96RV3 2341 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TLDC2A0PJX2 215 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CCL21O00585 134 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OR1F1O43749 312 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SERPIND1P05546 499 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 INHBAP08476 426 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HRH2P25021 359 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GP5P40197 560 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CD96P40200 585 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RGS4P49798 205 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ABRAXAS2Q15018 415 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RASA2Q15283 850 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CATSPEREQ5SY80 951 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 UGT3A1Q6NUS8 523 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 H3F3CQ6NXT2 135 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 LCTLQ6UWM7 567 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GALNT7Q86SF2 657 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SLC34A3Q8N130 599 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MFSD9Q8NBP5 474 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 MDS2Q8NDY4 140 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 THAP11Q96EK4 314 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PCBD2Q9H0N5 130 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PSMC3IPQ9P2W1 217 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 LGALS13Q9UHV8 139 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TEKT2Q9UIF3 430 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZNF180Q9UJW8 692 aa11.88□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 PDZD2O15018 2839 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 HMX2A2RU54 273 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ENO4A6NNW6 628 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 FAM227AF5H4B4 570 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NDUFS4O43181 175 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CDH16O75309 829 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GUCA1CO95843 209 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CRYABP02511 175 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CA7P43166 264 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 AGTR2P50052 363 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 AP2B1P63010 937 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SP140Q13342 867 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NSDHLQ15738 373 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 DEFB134Q4QY38 66 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GRTP1Q5TC63 336 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 SPINK14Q6IE38 97 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 NCCRP1Q6ZVX7 275 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 CYP4X1Q8N118 509 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GPATCH11Q8N954 259 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OR56A3Q8NH54 315 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 DNAJB8Q8NHS0 232 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 M1APQ8TC57 530 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 ZNF354BQ96LW1 612 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 TSNARE1Q96NA8 513 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 RBBP8Q99708 897 aa11.87□□□□□ -0.51
PRAME-212ENST00000485532 OLFM1Q99784 485 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms