RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 STX16O14662 325 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PCDH17O14917 1159 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SUV39H1O43463 412 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SMIM24O75264 130 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CYC1P08574 325 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 IL10P22301 178 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 HSD17B3P37058 310 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 Q0VFX4 171 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 MYBPC3Q14896 1274 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 MINDY4Q4G0A6 757 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 GRHL2Q6ISB3 625 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 WDR93Q6P2C0 686 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 MED27Q6P2C8 311 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 NDUFAF7Q7L592 441 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ZNF605Q86T29 641 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PARP9Q8IXQ6 854 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 CNPY4Q8N129 248 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ACMSDQ8TDX5 336 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 UBE2E3Q969T4 207 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 OR1F2PQ96R84 312 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 IPPKQ9H8X2 491 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa19.77■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 A0A1W2PPM1 405 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 GOLGA8RI6L899 631 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ERI3O43414 337 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 HPP00738 406 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 FHP07954 510 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PYGBP11216 843 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SLCO1A2P46721 670 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 BTN3A2P78410 334 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PCOLCEQ15113 449 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 LIPJQ5W064 366 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 SH2D5Q6ZV89 423 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 LCA5Q86VQ0 697 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TDRPQ86YL5 185 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CYP4X1Q8N118 509 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CA13Q8N1Q1 262 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PLPP5Q8NEB5 264 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 OR2L5Q8NG80 312 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 OR7G3Q8NG95 312 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 AENQ8WTP8 325 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TBC1D20Q96BZ9 403 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 QRFPRQ96P65 431 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RBCK1Q9BYM8 510 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ZNF160Q9HCG1 818 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PCTPQ9UKL6 214 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP19.76■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 A0A0G2JN53 185 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 FOXO6A8MYZ6 492 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 C8orf89P0DMQ9 161 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ITGA3P26006 1051 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PIK3CGP48736 1102 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RHAGQ02094 409 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 KLRB1Q12918 225 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RASA2Q15283 850 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ERCC6LQ2NKX8 1250 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 MFSD4BQ5TF39 518 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ABHD17CQ6PCB6 329 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 LANCL3Q6ZV70 420 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 L3MBTL4Q8NA19 623 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 METTL21AQ8WXB1 218 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 FAR2Q96K12 515 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 F2RL3Q96RI0 385 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 MS4A8Q9BY19 250 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ZNF700Q9H0M5 742 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ACTR8Q9H981 624 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PPCSQ9HAB8 311 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ZBTB26Q9HCK0 441 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 ANAPC2Q9UJX6 822 aa19.75■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 NUP210LQ5VU65 1888 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 A8MT66 165 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 OR7A17O14581 309 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 UGDHO60701 494 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PCNAP12004 261 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 HPDP32754 393 aaPredicted RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 PLA2G16P53816 162 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RUNX2Q13950 521 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 UBE3DQ7Z6J8 389 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 AMER2Q8N7J2 671 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 C5AR2Q9P296 337 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 RNF11Q9Y3C5 154 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa19.74■□□□□ 0.75
ACTB-211ENST00000480301 FASNP49327 2511 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms