RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 KERAO60938 352 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 B3GALT4O96024 378 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 HSPA7P48741 367 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ABRAXAS2Q15018 415 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NSDHLQ15738 373 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 EXT1Q16394 746 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 SIRT6Q8N6T7 355 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 MNS1Q8NEH6 495 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 UBTD2Q8WUN7 234 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 MS4A6EQ96DS6 147 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 EFCAB11Q9BUY7 163 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NPLQ9BXD5 320 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CD244Q9BZW8 370 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 MMP25Q9NPA2 562 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CD274Q9NZQ7 290 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 RNF112Q9ULX5 631 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ACOT9Q9Y305 439 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa22.04■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 DYTNA2CJ06 578 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 MTHFD2P13995 350 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 TFEBP19484 476 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 GMPRP36959 345 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 GLRBP48167 497 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 RAB8AP61006 207 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PDK4Q16654 411 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 RAPH1Q70E73 1250 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 VN1R5Q7Z5H4 357 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CATSPER1Q8NEC5 780 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ESAMQ96AP7 390 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ALG9Q9H6U8 611 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 A0A087X1B8 175 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 TRAV17A0A0B4J275 112 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CDK2AP1O14519 115 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CLGNO14967 610 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 C2P06681 752 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 RNH1P13489 461 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 CD22P20273 847 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ECHS1P30084 290 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 HPDP32754 393 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PHBP35232 272 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 LAPTM5Q13571 262 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 DOC2AQ14183 400 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 SLMAPQ14BN4 828 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 INAQ16352 499 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 SFT2D3Q587I9 215 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 FHL5Q5TD97 284 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 AMER2Q8N7J2 671 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 ISL2Q96A47 359 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 QRFPRQ96P65 431 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 LPAR4Q99677 370 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 TEKT2Q9UIF3 430 aa22.02■■□□□ 1.12
C9orf3-215ENST00000478473 OLR1P78380 273 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 ARG2P78540 354 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 BTBD16Q32M84 506 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 LGI4Q8N135 537 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 CA13Q8N1Q1 262 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 OR2L5Q8NG80 312 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 FAR1Q8WVX9 515 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 TSLPQ969D9 159 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 NXNL1Q96CM4 212 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 SNX15Q9NRS6 342 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 ASB1Q9Y576 335 aa22.01■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 KLK8O60259 260 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 PRMT3O60678 531 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 WDPCPO95876 746 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 CTAGE8P0CG41 777 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 HNF4AP41235 474 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 MAGEA12P43365 314 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 ACAP2Q15057 778 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 NR6A1Q15406 480 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 FBXO48Q5FWF7 155 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 XKR6Q5GH73 641 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 PAGE2BQ5JRK9 111 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 MROH9Q5TGP6 573 aa22■■□□□ 1.11
C9orf3-215ENST00000478473 ABHD17BQ5VST6 288 aa22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms