RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472420.5

LRPPRC-208, Transcript of leucine rich pentatricopeptide repeat containing, humanhuman

TSL 2

Gene LRPPRC, Length 694 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPPRC-208ENST00000472420 TPSB2P20231 275 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PDHA2P29803 388 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 DNASE1L1P49184 302 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 GAB1Q13480 694 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 TPSAB1Q15661 275 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PGGHGQ32M88 737 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 FAM47EQ6ZV65 393 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RNF44Q7L0R7 432 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PCGF5Q86SE9 256 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 TBC1D21Q8IYX1 336 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ARRDC2Q8TBH0 407 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SLC44A1Q8WWI5 657 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 FAM81BQ96LP2 452 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 TM9SF2Q99805 663 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SYT3Q9BQG1 590 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 BPIFA1Q9NP55 256 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 IL26Q9NPH9 171 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SMOXQ9NWM0 555 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 QPCTLQ9NXS2 382 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ELOVL5Q9NYP7 299 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 VWC2LB2RUY7 222 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SGTAO43765 313 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 TNFSF13O75888 250 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 FKBP9O95302 570 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SLC9A1P19634 815 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 GPD1P21695 349 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PCMT1P22061 227 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 MMP8P22894 467 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PKLRP30613 574 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 XCR1P46094 333 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 AVPR1BP47901 424 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SLC6A12P48065 614 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 TRPC1P48995 793 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PRLHRP49683 370 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 KCNJ2P63252 427 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 IL13RA1P78552 427 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 GALNT2Q10471 571 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RPA4Q13156 261 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 DUSP8Q13202 625 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ITGA9Q13797 1035 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RCAN2Q14206 197 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SF1Q15637 639 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 LRRC8BQ6P9F7 803 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ZNF474Q6S9Z5 364 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 IL20RBQ6UXL0 311 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 DTX2Q86UW9 622 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 CSNK1A1LQ8N752 337 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 LINC01555Q8NAE3 123 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 OR51Q1Q8NH59 317 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ASB15Q8WXK1 588 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 TSLPQ969D9 159 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 C3orf49Q96BT1 292 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PAGE5Q96GU1 130 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 USP28Q96RU2 1077 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 LYSTQ99698 3801 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SOX7Q9BT81 388 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ADAP2Q9NPF8 381 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SACM1LQ9NTJ5 587 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 HCN3Q9P1Z3 774 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 DCTN4Q9UJW0 460 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 AP4E1Q9UPM8 1137 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 ASF1AQ9Y294 204 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 YARS2Q9Y2Z4 477 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 RNF115Q9Y4L5 304 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.5□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 PLXNB1O43157 2135 aa6.49□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 A0A0U1RQJ8 604 aa6.49□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 A6NHS1 94 aa6.49□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 SAGE2PA6NJ88 616 aa6.49□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 CCT8L1PA6NM43 557 aa6.49□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 MAGEB17A8MXT2 336 aa6.49□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 H0YGG7 62 aa6.49□□□□□ -1.37
LRPPRC-208ENST00000472420 H0YIG0 161 aa6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.4 ms