RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA6	P08185	405 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	JAK1	P23458	1154 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	GGT5	P36269	586 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	PLA2G16	P53816	162 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	LAPTM5	Q13571	262 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	NSDHL	Q15738	373 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	BTBD16	Q32M84	506 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	PNPLA2	Q96AD5	504 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	VPS4A	Q9UN37	437 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	B3GNT3	Q9Y2A9	372 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ASB1	Q9Y576	335 aa		13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880		A0A088AWK7	358 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	HMX2	A2RU54	273 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880		A8MUI8	341 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	PCDH17	O14917	1159 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJB6	O75190	326 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	F10	P00742	488 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	PRR35	P0CG20	571 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	EPB42	P16452	691 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	SOX8	P57073	446 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	OR4D2	P58180	307 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ARG2	P78540	354 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	FOXK1	P85037	733 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ACAP2	Q15057	778 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	PCOLCE	Q15113	449 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	PLEKHN1	Q494U1	663 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	LGSN	Q5TDP6	509 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ISLR2	Q6UXK2	745 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD37	Q7Z713	158 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	IQCK	Q8N0W5	287 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	AMER2	Q8N7J2	671 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	LRRN4CL	Q8ND94	238 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	TSLP	Q969D9	159 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	TUBB6	Q9BUF5	446 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF700	Q9H0M5	742 aa		13.96	□□□□□ -0.17
SSR4-208	ENST00000471880	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	DYTN	A2CJ06	578 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880		A8MUA0	341 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	FAM227A	F5H4B4	570 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	B3GALT2	O43825	422 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM24	O75264	130 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CLEC3A	O75596	197 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	SERPINA7	P05543	415 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ITGAM	P11215	1152 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ICAM2	P13598	275 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	EFNA3	P52797	238 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	AP2B1	P63010	937 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TGM3	Q08188	693 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	HYAL2	Q12891	473 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	INPP5J	Q15735	1006 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	MED27	Q6P2C8	311 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM205	Q6UW68	189 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	TRMT10C	Q7L0Y3	403 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PLD6	Q8N2A8	252 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CISD2	Q8N5K1	135 aa	Known RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RHEBL1	Q8TAI7	183 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	UBE2E3	Q969T4	207 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ATP6V1E2	Q96A05	226 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PHF21B	Q96EK2	531 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	WDR77	Q9BQA1	342 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	EHD1	Q9H4M9	534 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ACTR8	Q9H981	624 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF358	Q9NW07	568 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	CSAG2	Q9Y5P2	127 aa		13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	LRRK2	Q5S007	2527 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	LOC102723996	A0A087X1L8	192 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	LRIT2	A6NDA9	550 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	C4orf51	C9J302	202 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	RIPK2	O43353	540 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PRMT3	O60678	531 aa		13.94	□□□□□ -0.18
SSR4-208	ENST00000471880	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.94	□□□□□ -0.18

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