RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470965.1

HDAC10-208, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 810 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-208	ENST00000470965	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	CMTM7	Q96FZ5	175 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	APOPT1	Q96IL0	206 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	CENPK	Q9BS16	269 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	MS4A8	Q9BY19	250 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ROGDI	Q9GZN7	287 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	KLHL31	Q9H511	634 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ZBTB26	Q9HCK0	441 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	PPT2	Q9UMR5	302 aa		18.86	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	IDS	B3KWA1	339 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	AGPS	O00116	658 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	SUPT7L	O94864	414 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	MLYCD	O95822	493 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	TBX6	O95947	436 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	HEXB	P07686	556 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	HNRNPH1	P31943	449 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ARFIP1	P53367	373 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	EMP2	P54851	167 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	POLE2	P56282	527 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	RAB8A	P61006	207 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	CLC	Q05315	142 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF844	Q08AG5	666 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	TRAF3	Q13114	568 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ATP1A4	Q13733	1029 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	RBBP7	Q16576	425 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	SYT16	Q17RD7	645 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	PCSK4	Q6UW60	755 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	LRIG3	Q6UXM1	1119 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	MILR1	Q7Z6M3	343 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	BANP	Q8N9N5	519 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	TMEM237	Q96Q45	408 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	SMC6	Q96SB8	1091 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	AICDA	Q9GZX7	198 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ING2	Q9H160	280 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	SEMA4B	Q9NPR2	832 aa	Predicted RBP	18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	HCN3	Q9P1Z3	774 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	RNF11	Q9Y3C5	154 aa		18.85	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965		G3V2L1	256 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	RGS16	O15492	202 aa	Predicted RBP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	JAK1	P23458	1154 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	TSFM	P43897	325 aa	Known RBP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	DNAJB13	P59910	316 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	CPSF6	Q16630	551 aa	Known RBP eCLIP	18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	UNC50	Q53HI1	259 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ABHD17C	Q6PCB6	329 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	SHISA6	Q6ZSJ9	500 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	KCNC2	Q96PR1	638 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	TBCD	Q9BTW9	1192 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	PRM3	Q9NNZ6	103 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	DMRT3	Q9NQL9	472 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ACSS2	Q9NR19	701 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	PLLP	Q9Y342	182 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965	ITPR1	Q14643	2758 aa		18.84	■□□□□ 0.61
HDAC10-208	ENST00000470965		A0A1W2PQ72	361 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ARGFX	A6NJG6	315 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965		H3BQF6	201 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	SOCS6	O14544	535 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	FFAR3	O14843	346 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	GPR42	O15529	346 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CHST10	O43529	356 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	B3GALT2	O43825	422 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	RNH1	P13489	461 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	MTTP	P55157	894 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	FOXL2	P58012	376 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	BTN3A2	P78410	334 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	RCN2	Q14257	317 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	KHDRBS2	Q5VWX1	349 aa	Known RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	PRSS58	Q8IYP2	241 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	CCDC63	Q8NA47	563 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	OR4F6	Q8NGB9	312 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TBC1D20	Q96BZ9	403 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	QRFPR	Q96P65	431 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	SERINC2	Q96SA4	455 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	ZNF382	Q96SR6	550 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	COPS7B	Q9H9Q2	264 aa	Predicted RBP	18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	TRPS1	Q9UHF7	1281 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		18.83	■□□□□ 0.6
HDAC10-208	ENST00000470965	C4orf51	C9J302	202 aa		18.82	■□□□□ 0.6

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