RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450353.3

LINC00174-208, long intergenic non-protein coding RNA 174, human

TSL 5

Gene LINC00174, Length 1,303 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINC00174-208	ENST00000450353	CELA2A	P08217	269 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	NCF1	P14598	390 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	CD1D	P15813	335 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	CRABP2	P29373	138 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	GDF5	P43026	501 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	MAGEA4	P43358	317 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	GPX6	P59796	221 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	RAB8A	P61006	207 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	HYAL2	Q12891	473 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	MEP1A	Q16819	746 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	ACER2	Q5QJU3	275 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	CEP128	Q6ZU80	1094 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	CCDC25	Q86WR0	208 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PDPR	Q8NCN5	879 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	STAG3L4	Q8TBR4	150 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	ADAMTS18	Q8TE60	1221 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	KIAA1191	Q96A73	305 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	FAR2	Q96K12	515 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	UBXN10	Q96LJ8	280 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	EFCAB11	Q9BUY7	163 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	NPL	Q9BXD5	320 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PRDM9	Q9NQV7	894 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	CD274	Q9NZQ7	290 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PLEKHB1	Q9UF11	243 aa	Predicted RBP	10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PRDM4	Q9UKN5	801 aa		10.5	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PTPN13	Q12923	2485 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	OR2W5	A6NFC9	320 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	CLEC3A	O75596	197 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	LDLR	P01130	860 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	HNF4A	P41235	474 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PER3	P56645	1201 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	SLC26A5	P58743	744 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	DMTN	Q08495	405 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	LAPTM5	Q13571	262 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PDK4	Q16654	411 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	C4orf17	Q53FE4	359 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	LCE2D	Q5TA82	110 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	C8orf74	Q6P047	294 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	RAPH1	Q70E73	1250 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TBC1D1	Q86TI0	1168 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	10.49	□□□□□ -0.73	2e-6	■■■■■ 163.7
LINC00174-208	ENST00000450353	SPATA6L	Q8N4H0	392 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	HORMAD2	Q8N7B1	307 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PPM1N	Q8N819	430 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	FBF1	Q8TES7	1133 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	NR4A3	Q92570	626 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TSLP	Q969D9	159 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	WDR34	Q96EX3	536 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	NMRAL1	Q9HBL8	299 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	ERRFI1	Q9UJM3	462 aa	Predicted RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	RNF112	Q9ULX5	631 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	MMACHC	Q9Y4U1	282 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	PCM1	Q15154	2024 aa		10.49	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	IGKV3D-11	A0A0A0MRZ8	115 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TCRBV16S1A1N1	A0A5B0	115 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	LRIT2	A6NDA9	550 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	CLDN4	O14493	209 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TAPBP	O15533	448 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	B4GALT2	O60909	372 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	HSPA7	P48741	367 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	OLR1	P78380	273 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	BTN3A2	P78410	334 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TGM3	Q08188	693 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	RCN2	Q14257	317 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	SLMAP	Q14BN4	828 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TERF2	Q15554	542 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	OR4D1	Q15615	310 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TBCC	Q15814	346 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	ZNF800	Q2TB10	664 aa	Predicted RBP eCLIP	10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	C18orf21	Q32NC0	220 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	TRIM40	Q6P9F5	258 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	SHISA5	Q8N114	240 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	BEST3	Q8N1M1	668 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	CA13	Q8N1Q1	262 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	C17orf53	Q8N3J3	647 aa	Predicted RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	SNX31	Q8N9S9	440 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	C7orf57	Q8NEG2	295 aa		10.48	□□□□□ -0.73
LINC00174-208	ENST00000450353	OR2L5	Q8NG80	312 aa		10.48	□□□□□ -0.73

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