RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 DLX3O60479 287 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CEACAM4O75871 244 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CLDN9O95484 217 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HEXBP07686 556 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT4P19013 534 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IMPDH1P20839 514 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 XCR1P46094 333 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PRKAA2P54646 552 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HERVK_113P63132 956 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TGM3Q08188 693 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC153Q494R4 210 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM35AQ53FP2 167 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM205Q6UW68 189 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PRSS58Q8IYP2 241 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP6V1E2Q96A05 226 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC126Q96EE4 140 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD17AQ96GS6 310 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FAR2Q96K12 515 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ERVK-6Q9BXR3 956 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MS4A8Q9BY19 250 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM55Q9BYV6 548 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HCN3Q9P1Z3 774 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 EMCNQ9ULC0 261 aa15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 NBEAQ8NFP9 2946 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 LOC102723996A0A087X1L8 192 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXO6A8MYZ6 492 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ERI3O43414 337 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CCL11P51671 97 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 BTN3A2P78410 334 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TUBB8Q3ZCM7 444 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF678Q5SXM1 525 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DEPDC1Q5TB30 811 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CPZQ66K79 652 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ADNP2Q6IQ32 1131 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TCTN3Q6NUS6 607 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD17CQ6PCB6 329 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CHSY3Q70JA7 882 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PLPP5Q8NEB5 264 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MYRIPQ8NFW9 859 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR11G2Q8NGC1 345 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR5T3Q8NGG3 340 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TBC1D20Q96BZ9 403 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 QRFPRQ96P65 431 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA4CQ9C0C4 833 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ROGDIQ9GZN7 287 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PRDM7Q9NQW5 492 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MKL2Q9ULH7 1088 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PPT2Q9UMR5 302 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PLAAQ9Y263 795 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF11Q9Y3C5 154 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CCDC88CQ9P219 2028 aa15.92■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF860A6NHJ4 632 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 C4orf51C9J302 202 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 COPEO14579 308 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL41O60662 606 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PLIN3O60664 434 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 DNAJB6O75190 326 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ALOX12BO75342 701 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 JRKO75564 520 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 B3GALT4O96024 378 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OTCP00480 354 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PROCP04070 461 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PCNAP12004 261 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ACPPP15309 386 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CCNG1P51959 295 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ARFIP1P53367 373 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 NAA20P61599 178 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CLCQ05315 142 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 UNC50Q53HI1 259 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 ZYG11AQ6WRX3 759 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MILR1Q7Z6M3 343 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 TRABD2AQ86V40 505 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 IQCKQ8N0W5 287 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 OR52B6Q8NGF0 335 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 RDH11Q8TC12 318 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 L3HYPDHQ96EM0 354 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 PEX11GQ96HA9 241 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 KCNC2Q96PR1 638 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 F2RL3Q96RI0 385 aa15.91■□□□□ 0.14
RABGEF1-204ENST00000442563 SERINC2Q96SA4 455 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56 ms