RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440016.6

HOXD-AS2-202, HOXD cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXD-AS2, Length 999 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP6V1E2Q96A05 226 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PEX11GQ96HA9 241 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MESP1Q9BRJ9 268 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MS4A8Q9BY19 250 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LGALS13Q9UHV8 139 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MKL2Q9ULH7 1088 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF11Q9Y3C5 154 aa25.65■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERI3O43414 337 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLDN9O95484 217 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRB1P04280 392 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SFTPCP11686 197 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 KRT4P19013 534 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HPDP32754 393 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CRHR1P34998 444 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCT5P48643 541 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCL11P51671 97 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCNG1P51959 295 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC18A2Q05940 514 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DCAF10Q5QP82 559 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C4orf33Q8N1A6 199 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR2L5Q8NG80 312 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABHD17AQ96GS6 310 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDK15Q96Q40 435 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 NTMT1Q9BV86 223 aa25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP25.64■■□□□ 1.7
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SCN2AQ99250 2005 aa25.64■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 A0A0G2JN53 185 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 H0YIV9 168 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 COPEO14579 308 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CHST10O43529 356 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SERPINB1P30740 379 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HERVK_113P63132 956 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 BTN3A2P78410 334 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRAF3Q13114 568 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRIM40Q6P9F5 258 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAR2Q96K12 515 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 F2RL3Q96RI0 385 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ERVK-6Q9BXR3 956 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RBCK1Q9BYM8 510 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRM3Q9NNZ6 103 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ADGRE2Q9UHX3 823 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FBXL4Q9UKA2 621 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 GRID1Q9ULK0 1009 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa25.63■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MKRN2OSH3BPM6 223 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MASP2O00187 686 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PROCP04070 461 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IL10P22301 178 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLA2G16P53816 162 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CDH13P55290 713 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TUBB8Q3ZCM7 444 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MINDY4Q4G0A6 757 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 UNC50Q53HI1 259 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZNF678Q5SXM1 525 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 MFSD4BQ5TF39 518 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FAAH2Q6GMR7 532 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ABHD17CQ6PCB6 329 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TRABD2AQ86V40 505 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC22A9Q8IVM8 553 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 RNF175Q8N4F7 328 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR11G2Q8NGC1 345 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 HUS1BQ8NHY5 278 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C9orf43Q8TAL5 461 aaPredicted RBP25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 C8orf44Q96CB5 159 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 REPS1Q96D71 796 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 QRFPRQ96P65 431 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM237Q96Q45 408 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 OR1F2PQ96R84 312 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TMEM109Q9BVC6 243 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VN1R1Q9GZP7 353 aa25.62■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TGFB1P01137 390 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ACPPP15309 386 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 TSPAN8P19075 237 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 IMPDH1P20839 514 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PRKAA2P54646 552 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CCDC153Q494R4 210 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CA13Q8N1Q1 262 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CLEC1AQ8NC01 280 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 VPS50Q96JG6 964 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SLC25A18Q9H1K4 315 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 LANCL2Q9NS86 450 aa25.61■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 G3V2L1 256 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PPP6CO00743 305 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 PLIN3O60664 434 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 ALOX12BO75342 701 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SH3BGRLO75368 114 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 CEACAM4O75871 244 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 SUPT7LO94864 414 aa25.6■■□□□ 1.69
HOXD-AS2-202ENST00000440016 FHP07954 510 aa25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms