RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433541.1

TREX1-201, Transcript of three prime repair exonuclease 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TREX1, Length 1,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX1-201ENST00000433541 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CHSY3Q70JA7 882 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 OR4F6Q8NGB9 312 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 HUS1BQ8NHY5 278 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 L3HYPDHQ96EM0 354 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 CMTM7Q96FZ5 175 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 F2RL3Q96RI0 385 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 NTMT1Q9BV86 223 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ELOVL6Q9H5J4 265 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ZBTB26Q9HCK0 441 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 C14orf105Q9NVL8 296 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 SLC17A7Q9P2U7 560 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 COPG2Q9UBF2 871 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 PLLPQ9Y342 182 aa14.71□□□□□ -0.05
TREX1-201ENST00000433541 ZFHX4Q86UP3 3567 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 SAP18O00422 153 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 OR4F21O95013 312 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 NEFHP12036 1026 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 SSR2P43308 183 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 KLC1Q07866 573 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 TRAF3Q13114 568 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 SSPNQ14714 243 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 LIPMQ5VYY2 423 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 FAAH2Q6GMR7 532 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 BORAQ6PGQ7 559 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PDSS2Q86YH6 399 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 C10orf107Q8IVU9 208 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 LAS2Q8IYD9 372 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 RNF175Q8N4F7 328 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 AMER3Q8N944 861 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 L3MBTL4Q8NA19 623 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 OR2L5Q8NG80 312 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 OR51Q1Q8NH59 317 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 EXTL1Q92935 676 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 MS4A6EQ96DS6 147 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PEX11GQ96HA9 241 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 SLC26A1Q9H2B4 701 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 C3orf18Q9UK00 162 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 MKL2Q9ULH7 1088 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 SNX6Q9UNH7 406 aa14.7□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 LRIT2A6NDA9 550 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 H0YIV9 168 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 B3GALT2O43825 422 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 FURINP09958 794 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 CREB1P16220 341 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PIK3CBP42338 1070 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 CCR10P46092 362 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 NEK2P51955 445 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 RPS13P62277 151 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 RHDQ02161 417 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PCDH1Q08174 1060 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 HYAL2Q12891 473 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 LCP2Q13094 533 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PCLAFQ15004 111 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 AP5B1Q2VPB7 878 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 CDYL2Q8N8U2 506 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 OR5T3Q8NGG3 340 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 THAP4Q8WY91 577 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PGM2Q96G03 612 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 VPS50Q96JG6 964 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 KCNC2Q96PR1 638 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 MS4A8Q9BY19 250 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 ROGDIQ9GZN7 287 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 OR51B5Q9H339 312 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 DMRT3Q9NQL9 472 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 OXSMQ9NWU1 459 aa14.69□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 ITPR1Q14643 2758 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 LAMA5O15230 3695 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 MGAQ8IWI9 3026 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 ARGFXA6NJG6 315 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 MAGEB17A8MXT2 336 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 IDSB3KWA1 339 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PPP6CO00743 305 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 CHST10O43529 356 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 TRIM13O60858 407 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 ONECUT2O95948 504 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 IGHEP01854 428 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 KRT6AP02538 564 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 KRT6BP04259 564 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 KRT6CP48668 564 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 EMP2P54851 167 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 PKNOX1P55347 436 aa14.68□□□□□ -0.06
TREX1-201ENST00000433541 NAA20P61599 178 aa14.68□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms