RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 KPNA4O00629 521 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLD2O14939 933 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TBX1O43435 398 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PAPLNO95428 1278 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CD70P32970 193 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DDOSTP39656 456 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AGFG1P52594 562 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C19orf57Q0VDD7 668 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FHL1Q13642 323 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LARS2Q15031 903 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF181Q2M3W8 571 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM151BQ6UXP7 276 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM91Q6ZNR0 172 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OTOP2Q7RTS6 562 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PAGE2Q7Z2X7 111 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZER1Q7Z7L7 766 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GALNT5Q7Z7M9 940 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SETD9Q8NE22 299 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 B3GNT7Q8NFL0 401 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC9Q92623 222 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DPY30Q9C005 99 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EHD1Q9H4M9 534 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BRD9Q9H8M2 597 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RB1P06400 928 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD3B1P14060 373 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF30P17039 623 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ENGP17813 658 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NUDT6P53370 316 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ACLYP53396 1101 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF45Q02386 682 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CRHR2Q13324 411 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNA10Q16322 511 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFA5Q16718 116 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM209AQ5JX71 171 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf120Q5SQS8 335 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FUT10Q6P4F1 479 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FCGR1BQ92637 280 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MGLLQ99685 303 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NRTNQ99748 197 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COPS4Q9BT78 406 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ITM2CQ9NQX7 267 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF186Q9NXI6 227 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLDN9O95484 217 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC16A8O95907 504 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C9P02748 559 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 THY1P04216 161 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IL7P13232 177 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 THPOP40225 353 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TGM4P49221 684 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GZMKP49863 264 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ST13P50502 369 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF91Q05481 1191 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COLEC12Q5KU26 742 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TPRG1LQ5T0D9 272 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PPP2R2DQ66LE6 453 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLAG1Q6DJT9 500 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MORN4Q8NDC4 146 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MCFD2Q8NI22 146 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PLD4Q96BZ4 506 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 COL21A1Q96P44 957 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RASSF1Q9NS23 344 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IL20RAQ9UHF4 553 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLEC2DQ9UHP7 191 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NUMA1Q14980 2115 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A0G2JK05 382 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 A0A1W2PQ67 120 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FADS2P1A8MWK0 482 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 B4DXG7 233 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD3B2P26439 372 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 THBS2P35442 1172 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DCDC1P59894 354 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CTXN3Q4LDR2 81 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM26EQ8N5C1 309 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HSD17B8Q92506 261 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SCAMP4Q969E2 229 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF34Q969K3 372 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ING2Q9H160 280 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C3orf14Q9HBI5 128 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZMYM5Q9UJ78 669 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BOLA1Q9Y3E2 137 aa3.47□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf81A6NN90 581 aa3.47□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.3 ms