RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000414620.1

ACTB-202, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 561 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-202ENST00000414620 SLC5A8Q8N695 610 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MDS2Q8NDY4 140 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 CDCP1Q9H5V8 836 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-202ENST00000414620 URADA6NGE7 173 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GTF3C1Q12789 2109 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NIPAL1Q6NVV3 410 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 QSOX2Q6ZRP7 698 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CA13Q8N1Q1 262 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TRPV3Q8NET8 790 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CREB3L4Q8TEY5 395 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PYROXD1Q8WU10 500 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 EXT2Q93063 718 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ESAMQ96AP7 390 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RHBDF1Q96CC6 855 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 WWOXQ9NZC7 414 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 EML6Q6ZMW3 1958 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ARHGAP10A1A4S6 786 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SAGE2PA6NJ88 616 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PRSS44E7EML9 344 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NDC80O14777 642 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RAD51CO43502 376 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PRMT3O60678 531 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SERPINA6P08185 405 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SMIM10L1P0DMW3 83 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RNH1P13489 461 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CD46P15529 392 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GMPRP36959 345 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SLC6A12P48065 614 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 HNMTP50135 292 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 BTN3A2P78410 334 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 BBOF1Q8ND07 529 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ELP5Q8TE02 316 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ANKRD7Q92527 254 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RELTQ969Z4 430 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SCMH1Q96GD3 660 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SMIM10Q96HG1 83 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TMEM79Q9BSE2 394 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MCMBPQ9BTE3 642 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CCL21O00585 134 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TAPBPO15533 448 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ERI3O43414 337 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 WISP3O95389 354 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GNAZP19086 355 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 HSPA7P48741 367 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RBPJQ06330 500 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CALCOCO2Q13137 446 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TGFBIQ15582 683 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ADNP2Q6IQ32 1131 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SNX31Q8N9S9 440 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CDKL2Q92772 493 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CCDC120Q96HB5 630 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 DERL2Q9GZP9 239 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PRDM9Q9NQV7 894 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 LRFN1Q9P244 771 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 COPG2Q9UBF2 871 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RNF14Q9UBS8 474 aa14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 FAM187AA6NFU0 413 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NPIPA5E9PKD4 350 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 ZNHIT1O43257 154 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 NEURL1O76050 574 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CCDC166P0CW27 439 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CD1DP15813 335 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 CA7P43166 264 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 POU4F1Q01851 419 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 RUNX2Q13950 521 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 OR4D1Q15615 310 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa14.55□□□□□ -0.08
ACTB-202ENST00000414620 FAM47BQ8NA70 645 aa14.55□□□□□ -0.08
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