RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362897.1

RNU6-78P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 78, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-78P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-78P-201ENST00000362897 LUMP51884 338 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM50BP56557 158 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 STX1BP61266 288 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 DHODHQ02127 395 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC3A1Q07837 685 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ARHGAP1Q07960 439 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NECTIN1Q15223 517 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FCN2Q15485 313 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAPK11Q15759 364 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAM189A2Q15884 450 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMU1Q2TAY7 513 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOGAT2Q3SYC2 334 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FUT11Q495W5 492 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CCDC184Q52MB2 194 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ODF2Q5BJF6 829 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SPANXN4Q5MJ08 99 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC27A4Q6P1M0 643 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LCLAT1Q6UWP7 414 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF497Q6ZNH5 498 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C17orf107Q6ZR85 190 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 KCTD9Q7L273 389 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC22A15Q8IZD6 547 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 METTL4Q8N3J2 472 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C10orf53Q8N6V4 93 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMEM99Q8N816 258 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 RNF149Q8NC42 400 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGAP3Q96P47 875 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PANX3Q96QZ0 392 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF559Q9BR84 538 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 OVOL2Q9BRP0 275 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 UBAC1Q9BSL1 405 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SYT11Q9BT88 431 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NLGN3Q9NZ94 848 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TMED7Q9Y3B3 224 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYH15Q9Y2K3 1946 aa2.3□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LOC105371242A0A075B767 164 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A087X0K7 114 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0J9YWU9 116 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRD1A4D1F6 860 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MPTX1A8MV57 137 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF732B4DXR9 585 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TCP10L2B9ZVM9 353 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 K7EQD1 137 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SIGLEC5O15389 551 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MLNRO43193 412 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 DCXO43602 365 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FMO6PO60774 539 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NME6O75414 186 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MYOGP15173 224 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEB1P43366 347 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 BTG1P62324 171 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FKBP1BP68106 108 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 CNTN1Q12860 1018 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 GCKRQ14397 625 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MORF4L2Q15014 288 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 IFI44LQ53G44 452 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C2CD6Q53TS8 623 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 AGAP6Q5VW22 663 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 FAAP20Q6NZ36 180 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF613Q6PF04 617 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 Q6ZVQ6 151 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 DND1Q8IYX4 353 aaKnown RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ELMOD1Q8N336 334 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 AQP11Q8NBQ7 271 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR9Q2Q8NGE9 314 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR5M9Q8NGP3 310 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 OR13C5Q8NGS8 318 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SAP25Q8TEE9 199 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SEPT8Q92599 483 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 PTP4A1Q93096 173 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 BPIFA2Q96DR5 249 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MOCOSQ96EN8 888 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 C18orf12Q96KH6 178 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF599Q96NL3 588 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LGMNQ99538 433 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 LRRC2Q9BYS8 371 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SLC5A7Q9GZV3 580 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NAPBQ9H115 298 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 TRPC4Q9UBN4 977 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZHX2Q9Y6X8 837 aa2.29□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 NEDD4P46934 1319 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 ZNF559-ZNF177A0A0A6YYI6 481 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 MAGEB16A2A368 324 aa2.28□□□□□ -2.04
RNU6-78P-201ENST00000362897 SMIM30A4D0T7 59 aa2.28□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.4 ms