RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 GPR37L1O60883 481 aa17.08■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 RETP07949 1114 aa17.08■□□□□ 0.33
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ACTB-201ENST00000331789 C16orf72Q14CZ0 275 aa17.08■□□□□ 0.33
ACTB-201ENST00000331789 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa17.08■□□□□ 0.33
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ACTB-201ENST00000331789 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa17.08■□□□□ 0.33
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ACTB-201ENST00000331789 TAAR2Q9P1P5 351 aa17.08■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 GOT1L1Q8NHS2 421 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 TPSD1Q9BZJ3 242 aa17.07■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 SYNPO2LQ9H987 977 aa17.07■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP17.07■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 DUSP12Q9UNI6 340 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa17.07■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 PLA2G16P53816 162 aa17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 LRRC74AQ0VAA2 488 aa17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 SRMSQ9H3Y6 488 aa17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 KLF15Q9UIH9 416 aa17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 CD6P30203 668 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP17.06■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 RGNQ15493 299 aa17.06■□□□□ 0.32
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ACTB-201ENST00000331789 TBPL2Q6SJ96 375 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 GALNT10Q86SR1 603 aa17.06■□□□□ 0.32
ACTB-201ENST00000331789 NUDT13Q86X67 352 aa17.06■□□□□ 0.32
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