RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 CELA2AP08217 269 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 IL10P22301 178 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNTFP26441 200 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 GCAP28676 217 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 FOXK1P85037 733 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHAGQ02094 409 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRF8Q02556 426 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLC3Q6P597 504 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 KBTBD2Q8IY47 623 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 AMER2Q8N7J2 671 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 METTL21AQ8WXB1 218 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCT6BQ92526 530 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 GAL3ST3Q96A11 431 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PNPLA2Q96AD5 504 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 MS4A6EQ96DS6 147 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF358Q9NW07 568 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 SHANK1Q9Y566 2161 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 WFS1O76024 890 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR35P0CG20 571 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 GFAPP14136 432 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CASP2P42575 452 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCDH1Q08174 1060 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAPTM5Q13571 262 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGFBP7Q16270 282 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PFKFB4Q16877 469 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADPRMQ3LIE5 342 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PAGE2BQ5JRK9 111 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 IGFL2Q6UWQ7 119 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 TM9SF4Q92544 642 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSLPQ969D9 159 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 MIB2Q96AX9 1013 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 TBC1D20Q96BZ9 403 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMMP1LQ96LU5 166 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 AGAP4Q96P64 663 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 RHBGQ9H310 441 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPB41L4BQ9H329 900 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRIT2A6NDA9 550 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKDD1BA6NHY2 528 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC14BA6NHZ5 514 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERI3O43414 337 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 SERPINA7P05543 415 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 MYBL2P10244 700 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX35Q5T0J7 233 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CA13Q8N1Q1 262 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 TEX9Q8N6V9 391 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLPP5Q8NEB5 264 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSMF1Q92530 271 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBB6Q9BUF5 446 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 XPR1Q9UBH6 696 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PLAAQ9Y263 795 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSAG2Q9Y5P2 127 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0G2JN53 185 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 TTLL8A6PVC2 850 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAGEB17A8MXT2 336 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 EPB42P16452 691 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX11P35716 441 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTN3A2P78410 334 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ABRAXAS2Q15018 415 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRR30Q53SZ7 412 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZADH2Q8N4Q0 377 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2L5Q8NG80 312 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 QRFPRQ96P65 431 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ITGAMP11215 1152 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 COL6A2P12110 1019 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNH1P13489 461 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 JAK1P23458 1154 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 MFAP5Q13361 173 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 CRB2Q5IJ48 1285 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 GRHL2Q6ISB3 625 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ADGRD1Q6QNK2 874 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 ISLR2Q6UXK2 745 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 Q6ZS92 163 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 LAS2Q8IYD9 372 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 PPP4R1Q8TF05 950 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAR2Q96K12 515 aa18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms