RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322326.12

IFT20-201, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 2

Gene IFT20, Length 820 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-201ENST00000322326 TTLQ8NG68 377 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TWIST2Q8WVJ9 160 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TRAPPC9Q96Q05 1148 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 CCT7Q99832 543 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 FAM107BQ9H098 131 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SPNS1Q9H2V7 528 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SOHLH2Q9NX45 425 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ADGRE2Q9UHX3 823 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 KCND3Q9UK17 655 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 USH1CQ9Y6N9 552 aa15.2■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 LRRK2Q5S007 2527 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TRPC5OSA6NMA1 111 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 HAT1O14929 419 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 OR1F1O43749 312 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ULK1O75385 1050 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ST6GAL1P15907 406 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 DRD4P21917 467 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 F8A1P23610 371 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SERPINB3P29508 390 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 RELAQ04206 551 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ERV3-1Q14264 604 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 FCRL6Q6DN72 434 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 RNF165Q6ZSG1 346 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 KMT5CQ86Y97 462 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 DDIASQ8IXT1 998 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 OR7G3Q8NG95 312 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SELENOMQ8WWX9 145 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 THAP11Q96EK4 314 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TCTN2Q96GX1 697 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 PPM1MQ96MI6 270 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SARGQ9BW04 601 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 KLHL25Q9H0H3 589 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 NPHS2Q9NP85 383 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 CROTQ9UKG9 612 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 DNAJC15Q9Y5T4 150 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 FLNCQ14315 2725 aa15.19■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 FEZF1A0PJY2 475 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 PIP5K1BO14986 540 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 CCNYL3P0C7X3 344 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 HSD3B1P14060 373 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ZNF28P17035 718 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 HSD3B2P26439 372 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 AHRP35869 848 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 PIK3CBP42338 1070 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SCTRP47872 440 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 HTR6P50406 440 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 IL11RAQ14626 422 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 UGT3A2Q3SY77 523 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 C4orf17Q53FE4 359 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SGO1Q5FBB7 561 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TMTC4Q5T4D3 741 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ASB18Q6ZVZ8 466 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 RNF44Q7L0R7 432 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 PLD3Q8IV08 490 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 MFSD9Q8NBP5 474 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 GALNT6Q8NCL4 622 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ZNF740Q8NDX6 193 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 WDR20Q8TBZ3 569 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 C19orf60Q96EN9 201 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 OR6C1Q96RD1 312 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 RIC8BQ9NVN3 520 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SEMA5BQ9P283 1151 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 BTRCQ9Y297 605 aa15.18■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SLC28A1O00337 649 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 KIAA0754O94854 1291 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 PDYNP01213 254 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 BCL6P41182 706 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SEPHS1P49903 392 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 AQP5P55064 265 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 MLLT10P55197 1068 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 BTKQ06187 659 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 IMPG1Q17R60 797 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 TRPV3Q8NET8 790 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 NUF2Q9BZD4 464 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 RHBGQ9H310 441 aa15.17■□□□□ 0.02
IFT20-201ENST00000322326 BRF2Q9HAW0 419 aa15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.4 ms