RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0G2JN53 185 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 RTCAO00442 366 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 BSGP35613 385 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSFMP43897 325 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACY1Q03154 408 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 KLF10Q13118 480 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR19Q15760 415 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPR135Q8IZ08 494 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDC26Q8NHZ8 85 aa26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 MSL3P1P0C860 447 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOLR1P15328 257 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SDC1P18827 310 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 RAE1P78406 368 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE3DQ7Z6J8 389 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB124Q8NES8 71 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TSSK3Q96PN8 268 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB18Q99592 522 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC106Q9BWC9 280 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 DPY30Q9C005 99 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 AICDAQ9GZX7 198 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2B3O76000 313 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GBAP04062 536 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ASMTP46597 345 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAPK12P53778 367 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 BTN3A2P78410 334 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF763Q0D2J5 394 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GRM7Q14831 915 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 HERC3Q15034 1050 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRTGQ2VWP7 1150 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGKQ53H12 422 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF285Q96NJ3 590 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 DDX31Q9H8H2 851 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 FGF21Q9NSA1 209 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZIM2Q9NZV7 527 aa26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 EEDO75530 441 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A3O75751 556 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 CDK4P11802 303 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ALOX12P18054 663 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GPX3P22352 226 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ITGA1P56199 1179 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SKP1P63208 163 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PAOXQ6QHF9 649 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 C6orf89Q6UWU4 347 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 GLRX5Q86SX6 157 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 PRDM7Q9NQW5 492 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC22A7Q9Y694 548 aa26.08■■□□□ 1.77
CTDNEP1-201ENST00000318988 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa26.08■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 HIST1H1TP22492 207 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 PIK3R1P27986 724 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTTPP55157 894 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 PTGR1Q14914 329 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 GARNL3Q5VVW2 1013 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 FAM91A1Q658Y4 838 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 CYB5D1Q6P9G0 228 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGBL5Q8NDL9 886 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR8K5Q8NH50 307 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLHC1Q8NHS4 586 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP26.07■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-201ENST00000318988 LHX9Q9NQ69 397 aa26.07■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 CCDC167Q9P0B6 97 aa26.07■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-201ENST00000318988 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 HYKKA2RU49 373 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 AGRPO00253 132 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 CTSBP07858 339 aa26.06■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 UFM1P61960 85 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 FOXM1Q08050 763 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 SLC9A5Q14940 896 aa26.06■■□□□ 1.76
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CTDNEP1-201ENST00000318988 DEFB134Q4QY38 66 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLDC1Q6P9B6 456 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 ACOT4Q8N9L9 421 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 NETO1Q8TDF5 533 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 STRADBQ9C0K7 418 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 TMEM45AQ9NWC5 275 aa26.06■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 GUCY1B2O75343 617 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 SMIM10L1P0DMW3 83 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 GSTM5P46439 218 aa26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLDN8P56748 225 aa26.05■■□□□ 1.76
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