RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 HSPBAP1Q96EW2 488 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SGCZQ96LD1 299 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PRAP1Q96NZ9 151 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HEMGNQ9BXL5 484 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TTTY12Q9BZ98 90 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RBSNQ9H1K0 784 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PRDM9Q9NQV7 894 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 KCMF1Q9P0J7 381 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NDRG3Q9UGV2 375 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NENFQ9UMX5 172 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa7.33□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 AKAP6Q13023 2319 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 AHRRA9YTQ3 701 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CLDN4O14493 209 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CD3EAPO15446 510 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 P2RX6O15547 441 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 B4GALT2O60909 372 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJB6O75190 326 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MBD3O95983 291 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ESR1P03372 595 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CD53P19397 219 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CNR1P21554 472 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OPRM1P35372 400 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 EFNA3P52797 238 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TCEAL1Q15170 157 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CCSMST1Q4G0I0 132 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HECTD2Q5U5R9 776 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RTL4Q6ZR62 310 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF227Q86WZ6 799 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 LACC1Q8IV20 430 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PALM2Q8IXS6 379 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PM20D2Q8IYS1 436 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 KIF2BQ8N4N8 673 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OR13J1Q8NGT2 312 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF592Q92610 1267 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TSLPQ969D9 159 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 Q96MF0 132 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 DACH2Q96NX9 599 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 GBP4Q96PP9 640 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RBCK1Q9BYM8 510 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OSBPL8Q9BZF1 889 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC68Q9H2F9 335 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 C10orf88Q9H8K7 445 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SACM1LQ9NTJ5 587 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HYOU1Q9Y4L1 999 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM215AQ9Y5M1 114 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HIVEP2P31629 2446 aa7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 JMJD1CQ15652 2540 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6AP2A0A1C7CYW4 349 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FEZF1A0PJY2 475 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 E7ENX8 843 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PJA2O43164 708 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CRLF1O75462 422 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6AP2O75787 350 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC16A8O95907 504 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RNH1P13489 461 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ALOX12P18054 663 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TIMP3P35625 211 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FDFT1P37268 417 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ADH7P40394 386 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HADHBP55084 474 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RWDD2BP57060 319 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TAP2Q03519 686 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 ACVR1Q04771 509 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 CBLBQ13191 982 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PWP1Q13610 501 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 RCN2Q14257 317 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 KLHL38Q2WGJ6 581 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 HMBOX1Q6NT76 420 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 OPN5Q6U736 354 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 SCIMPQ6UWF3 145 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 IL20RBQ6UXL0 311 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 MDGA2Q7Z553 956 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 C17orf64Q86WR6 236 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 PLD3Q8IV08 490 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 LIX1LQ8IVB5 337 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM251Q8N6I4 163 aa7.31□□□□□ -1.24
PGGT1B-201ENST00000296642 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
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