RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295925.5

CCNL1-201, Transcript of cyclin L1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CCNL1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1-201ENST00000295925 HUS1BQ8NHY5 278 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 EXTL1Q92935 676 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 GAL3ST3Q96A11 431 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MS4A6EQ96DS6 147 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CCDC126Q96EE4 140 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 FAR2Q96K12 515 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 NTMT1Q9BV86 223 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MS4A8Q9BY19 250 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SLC26A1Q9H2B4 701 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 WDR54Q9H977 334 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 DMRT3Q9NQL9 472 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SENP1Q9P0U3 644 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MID2Q9UJV3 735 aa15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 H0YIV9 168 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CD63P08962 238 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MYZAPP0CAP1 466 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CCR10P46092 362 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 XCR1P46094 333 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 NAGLUP54802 743 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 KLC1Q07866 573 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CFAP157Q5JU67 520 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 TRIM40Q6P9F5 258 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CROCCP2Q86T23 111 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 EXOC3L1Q86VI1 746 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 LAPTM4BQ86VI4 370 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 RAB43Q86YS6 212 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 OR2L5Q8NG80 312 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 OR51Q1Q8NH59 317 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 REPS1Q96D71 796 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 PEX11GQ96HA9 241 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SEC16BQ96JE7 1060 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CRB3Q9BUF7 120 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MECRQ9BV79 373 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 FAM117AQ9C073 453 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 OR51B5Q9H339 312 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 GSTO2Q9H4Y5 243 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 OXSMQ9NWU1 459 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 POLHQ9Y253 713 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa15.5■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MAGEB17A8MXT2 336 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 RTCAO00442 366 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CHST10O43529 356 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 TYROBPO43914 113 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SMIM10L1P0DMW3 83 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CERS1P27544 350 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SERPINB1P30740 379 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SKP1P63208 163 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 PHEXP78562 749 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 LCP2Q13094 533 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CHAF1BQ13112 559 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ATP1A4Q13733 1029 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 TBR1Q16650 682 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MINDY4Q4G0A6 757 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 TCHHL1Q5QJ38 904 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 FAAH2Q6GMR7 532 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MRGPREQ86SM8 312 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CDYL2Q8N8U2 506 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CMTM7Q96FZ5 175 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 PGM2Q96G03 612 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SMIM10Q96HG1 83 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ZNF382Q96SR6 550 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 MESP1Q9BRJ9 268 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 C3orf18Q9UK00 162 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ZNF225Q9UK10 706 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CACNA1GO43497 2377 aa15.49■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ITPR1Q14643 2758 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 LAMA5O15230 3695 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 OR2W5A6NFC9 320 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ARGFXA6NJG6 315 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ALDH3A1P30838 453 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 PIK3CBP42338 1070 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 RAP1GDS1P52306 607 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 DNAJB13P59910 316 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 TGM3Q08188 693 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 IFT88Q13099 833 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 SSPNQ14714 243 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 ADPRMQ3LIE5 342 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 GGTA1PQ4G0N0 100 aa15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
CCNL1-201ENST00000295925 LIPMQ5VYY2 423 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms