RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 C2orf54Q08AI8 447 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 SLC25A35Q3KQZ1 300 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 CDC20BQ86Y33 519 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 PLD3Q8IV08 490 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 MPP5Q8N3R9 675 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 KIF2BQ8N4N8 673 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 CAMKVQ8NCB2 501 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 OR52N2Q8NGI0 321 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 SPATA3Q8NHX4 192 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 CREB3L4Q8TEY5 395 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 THAP11Q96EK4 314 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 ZNF778Q96MU6 729 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 PRAP1Q96NZ9 151 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 SMR3AQ99954 134 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 DEFB127Q9H1M4 99 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 TMEM184CQ9NVA4 438 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa11.21□□□□□ -0.61
SPC25-201ENST00000282074 ZNF407Q9C0G0 2248 aa11.21□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FIGNL2A6NMB9 653 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FAM47E-STBD1D6RA91 191 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NPIPA2E9PIF3 369 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NPIPA3F8WFD2 350 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 H3BMM5 538 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SMAPO00193 183 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 BCKDKO14874 412 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 STATHP02808 62 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RAF1P04049 648 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 JAK1P23458 1154 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ACVR2AP27037 513 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RWDD2BP57060 319 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 KEAP1Q14145 624 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TMEM198Q66K66 360 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CYP4X1Q8N118 509 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TMEM156Q8N614 296 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NUDT8Q8WV74 236 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TSLPQ969D9 159 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PEX11GQ96HA9 241 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 HES6Q96HZ4 224 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PWWP2AQ96N64 755 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PKP4Q99569 1192 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 MDFIQ99750 246 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TTYH2Q9BSA4 534 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 MARCH4Q9P2E8 410 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TCAF1Q9Y4C2 921 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SCN3AQ9NY46 2000 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RTTNQ86VV8 2226 aa11.2□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 OR14I1A6ND48 311 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ERICH4A6NGS2 130 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 COL6A5A8TX70 2615 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 E7ENX8 843 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 E7EVH7 732 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ACOT7O00154 380 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PFDN6O15212 129 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RDH16O75452 317 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SLC16A8O95907 504 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 HEXAP06865 529 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 CHRM3P20309 590 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TAP2Q03519 686 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 GBX1Q14549 363 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 DEFB113Q30KQ7 82 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ZNF585AQ6P3V2 769 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PAMR1Q6UXH9 720 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RGS9BPQ6ZS82 235 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 VN1R4Q7Z5H5 301 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SHISA5Q8N114 240 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ARMC10Q8N2F6 343 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PPFIBP2Q8ND30 876 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FAM222BQ8WU58 562 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ZNF480Q8WV37 535 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 ARSGQ96EG1 525 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 LRRC46Q96FV0 321 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 MACROD1Q9BQ69 325 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 RBCK1Q9BYM8 510 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 LANCL2Q9NS86 450 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 PNPLA3Q9NST1 481 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 SLC22A7Q9Y694 548 aa11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FN1P02751 2386 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
SPC25-201ENST00000282074 FAM187AA6NFU0 413 aa11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms