RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA31D3P0C874 917 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 GKN3PP0CG01 181 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 DNAJB1P25685 340 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 UGCGQ16739 394 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 SMIM15Q7Z3B0 74 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 NANPQ8TBE9 248 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 KCNN1Q92952 543 aa13.91□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1B0GVM2 712 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 SMIM30A4D0T7 59 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 WASHC1A8K0Z3 465 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 ALDH3B1P43353 468 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 PRKAG1P54619 331 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 BAK1Q16611 211 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF311Q5JNZ3 666 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 LIX1Q8N485 282 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 ZBTB44Q8NCP5 570 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 OR1J4Q8NGS1 313 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 A8MUA0 341 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 UCHL1P09936 223 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 GTF2F2P13984 249 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 MAGEB1P43366 347 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 ERVK-21P61565 698 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 RAET1GQ6H3X3 334 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 NANOGP8Q6NSW7 305 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 TAPT1Q6NXT6 567 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 RNF44Q7L0R7 432 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 FAM122BQ7Z309 247 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 WDR48Q8TAF3 677 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 SLC38A1Q9H2H9 487 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 TEX10Q9NXF1 929 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF175Q9Y473 711 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 SHPRHQ149N8 1683 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 YDJCA8MPS7 323 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF254O75437 659 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 CREG1O75629 220 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 SC5DO75845 299 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 PRNPP04156 253 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 HIST1H2ABP04908 130 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 SYN1P17600 705 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 HIST3H2AQ7L7L0 130 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 STK35Q8TDR2 534 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 HIST1H2ACQ93077 130 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 COMMD4Q9H0A8 199 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 NUDT4Q9NZJ9 180 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 COQ4Q9Y3A0 265 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 CDH10Q9Y6N8 788 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 PAGE1O75459 146 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 CAPN3P20807 821 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 CLCN4P51793 760 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 MBTD1Q05BQ5 628 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM151AQ8N4L1 468 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 NEIL3Q8TAT5 605 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 GPR151Q8TDV0 419 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 CSPG4P5Q96PW8 444 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 PDZD7Q9H5P4 517 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 DMAC2Q9NW81 257 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 IKZF2Q9UKS7 526 aa13.9□□□□□ -0.18
PTPRO-201ENST00000281171 KERAO60938 352 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 SSTR2P30874 369 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 UGT2B10P36537 528 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 HSDL1Q3SXM5 330 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 SLC30A6Q6NXT4 461 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 SLC16A9Q7RTY1 509 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 LRP10Q7Z4F1 713 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 FBXO22Q8NEZ5 403 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 KREMEN1Q96MU8 473 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 SLC25A51Q9H1U9 297 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 NME7Q9Y5B8 376 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 LCKP06239 509 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 PBX3P40426 434 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 STEAP3Q658P3 488 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 NRARPQ7Z6K4 114 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM192Q8IY95 271 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF454Q8N9F8 522 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 APOLD1Q96LR9 279 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 TXLNGYQ9BZA5 131 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 GPR88Q9GZN0 384 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PQ09 198 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 A0A1W2PQL4 384 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 SEPT4O43236 478 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 HTR1EP28566 365 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 CACNG1Q06432 222 aa13.89□□□□□ -0.19
PTPRO-201ENST00000281171 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms