RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264640.8

SMARCE1-201, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 631 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-201ENST00000264640 DPY30Q9C005 99 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 IPPKQ9H8X2 491 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 NANOGQ9H9S0 305 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 PISDQ9UG56 409 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 RSL24D1Q9UHA3 163 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A13Q9UJS0 675 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ERVW-1Q9UQF0 538 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 ORC6Q9Y5N6 252 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 LRP4O75096 1905 aa6.78□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 F8P00451 2351 aa6.77□□□□□ -1.32
SMARCE1-201ENST00000264640 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 EDDM13A0A1B0GTR0 161 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C7orf72A4D263 438 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SHISA8B8ZZ34 492 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PDLIM1O00151 329 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FXYD1O00168 92 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PPP6CO00743 305 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SCAMP1O15126 338 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC16A5O15375 505 aa6.77□□□□□ -1.33
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SMARCE1-201ENST00000264640 PRAMEF10O60809 474 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ERN1O75460 977 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 STK16O75716 305 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CLDN9O95484 217 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HPRP00739 348 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FBXO45P0C2W1 286 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PRSS56P0CW18 603 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MPC1LP0DKB6 136 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LIPCP11150 499 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC2A4P14672 509 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CD1EP15812 388 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ITIH1P19827 911 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2ADP20671 130 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CYP2A7P20853 494 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPK9P45984 424 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ALDH3B2P48448 385 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HNMTP50135 292 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CDK9P50750 372 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RPS6KA3P51812 740 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HK3P52790 923 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF33BQ06732 778 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CNTN1Q12860 1018 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SP140Q13342 867 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NFATC2Q13469 925 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 BIRC2Q13490 618 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SPIDRQ14159 915 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NR0B2Q15466 257 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FXNQ16595 210 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MAPKAPK3Q16644 382 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RFX4Q33E94 735 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZBED5Q49AG3 693 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TIGD2Q4W5G0 525 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NHSL2Q5HYW2 709 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 AGBL4Q5VU57 503 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TTC23Q5W5X9 447 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HMBOX1Q6NT76 420 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 FAM151BQ6UXP7 276 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 RAB11FIP2Q7L804 512 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 IFNEQ86WN2 208 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TRIM69Q86WT6 500 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SVOPLQ8N434 492 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CBR4Q8N4T8 237 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR4F6Q8NGB9 312 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OR52E4Q8NGH9 312 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZFP28Q8NHY6 868 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 MIB2Q96AX9 1013 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ITCHQ96J02 903 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC115Q96NT0 180 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CCDC3Q9BQI4 270 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 SLC39A3Q9BRY0 314 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 C1orf50Q9BV19 199 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 CEP44Q9C0F1 390 aa6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SMARCE1-201ENST00000264640 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.77□□□□□ -1.33
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