RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263202.14

UFD1-201, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UFD1, Length 1,814 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-201ENST00000263202 TRIM40Q6P9F5 258 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa21.59■■□□□ 1.05
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UFD1-201ENST00000263202 CDC26Q8NHZ8 85 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 C16orf78Q8WTQ4 265 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 VPS33AQ96AX1 596 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 QRFPRQ96P65 431 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 KCNC2Q96PR1 638 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 NUDT22Q9BRQ3 303 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 EFCAB1Q9HAE3 211 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 PRDM7Q9NQW5 492 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 SEMA5BQ9P283 1151 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 ADAMTS20P59510 1910 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 ASPDHA6ND91 283 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 CCDC154A6NI56 674 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 SSR2P43308 183 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 NUDT2P50583 147 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
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UFD1-201ENST00000263202 MMEL1Q495T6 779 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 TIGD2Q4W5G0 525 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 ZNF793Q6ZN11 406 aa21.59■■□□□ 1.05
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UFD1-201ENST00000263202 AMER3Q8N944 861 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 IFI44Q8TCB0 444 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 GAL3ST3Q96A11 431 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 TESCQ96BS2 214 aa21.59■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 NDUFAF1Q9Y375 327 aa21.59■■□□□ 1.05
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UFD1-201ENST00000263202 DYTNA2CJ06 578 aa21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 GYG2O15488 501 aa21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 AKAP10O43572 662 aa21.58■■□□□ 1.05
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UFD1-201ENST00000263202 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 GABRA4P48169 554 aa21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 DGKQP52824 942 aa21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 SLC25A3Q00325 362 aa21.58■■□□□ 1.05
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UFD1-201ENST00000263202 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 SPANXN4Q5MJ08 99 aa21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 MANEAQ5SRI9 462 aa21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 RETREG3Q86VR2 466 aa21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
UFD1-201ENST00000263202 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
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UFD1-201ENST00000263202 SMIM10L1P0DMW3 83 aa21.57■■□□□ 1.04
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UFD1-201ENST00000263202 TLR1Q15399 786 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 TMEM71Q6P5X7 295 aa21.57■■□□□ 1.04
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UFD1-201ENST00000263202 CSNK1A1LQ8N752 337 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 SMIM10Q96HG1 83 aa21.57■■□□□ 1.04
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UFD1-201ENST00000263202 SNAP47Q5SQN1 464 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 FAM71E1Q6IPT2 247 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 TMPRSS9Q7Z410 1059 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 TMEM132CQ8N3T6 1108 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 RXFP3Q9NSD7 469 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 MAP10Q9P2G4 905 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 MAPRE3Q9UPY8 281 aa21.57■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 GPR179Q6PRD1 2367 aa21.56■■□□□ 1.04
UFD1-201ENST00000263202 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
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